Simultaneous isolation and enumeration of virulent Vibrio cholerae and Vibrio vulnificus using an advanced MPN-PCR method
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Vibrio cholerae and Vibrio vulnificus are one of the critical foodborne pathogens that need to be intensively controlled their infection as a result of the intake and distribution of seafood, especially raw oysters. For this reason, various methods have already been developed for the detection and enumeration of these bacteria. The most probable number (MPN)-PCR (polymerase chain reaction) method is commonly used with the selective-differential medium for the efficiency and convenience of cell enumeration. One of the most frequently used for the detection of Vibrio spp. is Thiosulfate-Citrate-Bile salts-Sucrose (TCBS) agar. But this selective-differential medium can fail to distinguish between V. cholerae, V. vulnificus, and Vibrio alginolyticus. For this reason, the conventional MPN-PCR method with TCBS medium for the detection of Vibrio spp. has a problem that processing PCR to the two-times. This study suggests a simple and minimized detection method using one-time PCR and non-NaCl Luria-Bertani (LB-0) medium culture. This detection method is based on the difference in salt requirement between V. cholerae and V. vulnificus. Employing the developed methodology, the simultaneous cell enumeration of V. cholerae and V. vulnificus can be possible at a low cost. Furthermore, this study proposes a new specific primer to detect virulence-related genes from V. cholerae and V. vulnificus. This advanced MPN-PCR method was verified using bioaccumulated pacific oysters (Crassostrea gigas) by V. cholerae and V. vulnificus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».