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Enregistrement W4225985151 · doi:10.1177/11795484221075492

Detection of Anti-SARS-CoV-2 Nucleocapsid and Spike Antibodies in Patients with Coronavirus Disease 2019 in Japan

2022· article· en· W4225985151 sur OpenAlexfundno aff
Hiroshi Furukawa, Shomi Oka, Takashi Higuchi, Miho Yamaguchi, Shota Uchiyama, Tomohiro Koiwa, Moriyuki Nakama, Masaaki Minegishi, Hideaki Nagai, Shigeto Tohma

Notice bibliographique

RevueClinical Medicine Insights Circulatory Respiratory and Pulmonary Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPfizer JapanChugai PharmaceuticalEisai CanadaAstellas Foundation for Research on Metabolic DisordersAbbott JapanBristol-Myers SquibbTakeda Pharmaceutical CompanyMitsubishi Tanabe Pharma Corporation
Mots-clésSerologyMedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)AntibodyCoronavirusRheumatoid arthritisVirologyInternal medicineImmunologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) is caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Serological testing for anti-SARS-CoV-2 nucleocapsid (N) antibodies (Abs) and anti-SARS-CoV-2 spike (S) Abs is performed to detect prior COVID-19 infection. It is still controversial which antibodies are the most sensitive and specific, and which can be detected earliest after infection. Here, we evaluated the results of serological tests of anti-SARS-CoV-2 N and S Abs in Japan. METHODS: Symptomatic COVID-19 patients (n = 84) and control patients with rheumatoid arthritis (n = 93) were recruited at Tokyo National Hospital. Anti-SARS-CoV-2 N and S Abs were measured by commercial electrochemiluminescence immunoassays. RESULTS: The fraction of patients positive for anti-SARS-CoV-2 N and S Abs was highest >14 days after symptom onset. The frequency of anti-SARS-CoV-2 S Ab positivity at this time (80.4%) tended to be slightly but not significantly lower than anti-SARS-CoV-2 N Ab positivity (84.8%). Optimized cut-off levels for anti-SARS-CoV-2 N and S Ab positivity were lower than the manufacturer's recommended cut-off levels. Using multiple linear regression analyzes with anti-SARS-CoV-2 N and S Abs, we created an Ab-index with high sensitivity. CONCLUSION: To increase the sensitivity of serological diagnostic tests for COVID-19, it is suggested that both anti-SARS-CoV-2 N and S Abs should be measured and cut-off levels decreased.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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