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Enregistrement W4226064848 · doi:10.1016/j.epidem.2022.100559

Mathematical modeling of COVID-19 in British Columbia: An age-structured model with time-dependent contact rates

2022· article· en· W4226064848 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueEpidemics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityBC Centre for Disease ControlUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMichael Smith Health Research BC
Mots-clésPopulationMixing (physics)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Mixing patternsTransmission (telecommunications)DemographyEconometricsComputer scienceStatisticsMathematicsMedicineDiseaseInfectious disease (medical specialty)Physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Following the emergence of COVID-19 at the end of 2019, several mathematical models have been developed to study the transmission dynamics of this disease. Many of these models assume homogeneous mixing in the underlying population. However, contact rates and mixing patterns can vary dramatically among individuals depending on their age and activity level. Variation in contact rates among age groups and over time can significantly impact how well a model captures observed trends. To properly model the age-dependent dynamics of COVID-19 and understand the impacts of interventions, it is essential to consider heterogeneity arising from contact rates and mixing patterns. We developed an age-structured model that incorporates time-varying contact rates and population mixing computed from the ongoing BC Mix COVID-19 survey to study transmission dynamics of COVID-19 in British Columbia (BC), Canada. Using a Bayesian inference framework, we fit four versions of our model to weekly reported cases of COVID-19 in BC, with each version allowing different assumptions of contact rates. We show that in addition to incorporating age-specific contact rates and mixing patterns, time-dependent (weekly) contact rates are needed to adequately capture the observed transmission dynamics of COVID-19. Our approach provides a framework for explicitly including empirical contact rates in a transmission model, which removes the need to otherwise model the impact of many non-pharmaceutical interventions. Further, this approach allows projection of future cases based on clear assumptions of age-specific contact rates, as opposed to less tractable assumptions regarding transmission rates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,375
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,170
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle