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Enregistrement W4226085515 · doi:10.1002/mats.202200016

A Comparative Assessment of Human Serum Proteins Interactions with Hemodialysis Clinical Membranes using Molecular Dynamics Simulation

2022· article· en· W4226085515 sur OpenAlexaff
Arash Mollahosseini, Shaghayegh Saadati, Amira Abdelrasoul

Notice bibliographique

RevueMacromolecular Theory and Simulations · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
Thématiquebiodegradable polymer synthesis and properties
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCellulose triacetateMolecular dynamicsChemistryPolymervan der Waals forcePopulationBiocompatibilityMembranePolyacrylonitrileMethacrylatePolymer chemistryMaterials scienceOrganic chemistryMonomerComputational chemistryMoleculeBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract End stage renal disease (ESRD) affects ≈10% of the world's population. Hemodialysis (HD) is a life‐sustaining extracorporeal blood purifying treatment for ESRD patients. Despite the advances in technology, the hemoincompatibility of the dialyzers leads to a high morbidity and mortality rate. Decreasing interactions between polymers and blood constituents will result in controlled binding of human serum proteins to the surface and consequently enhanced biocompatibility. This study aims to assess the interaction energy between common hemodialysis polymer structures and human serum proteins using molecular dynamics simulation to offer a framework for understanding the dominant interactions as a reference for material development. Molecular dynamics and molecular docking simulations are conducted for calculating polymerprotein binding energies. Common serum proteins are selected for protein models. Poly aryl ether sulfone (PAES) with and without polyvinyl pyrrolidone (PVP), polyvinylidene fluoride (PVDF), cellulose triacetate (CTA), polyacrylonitrile (PAN), and polymethyl methacrylate (PMMA) membrane structures are chosen as the different classes of dialyzers. The van der Waals interactions between polymers and proteins dominate the binding energies sequence. Molecular docking results of the affinity between protein receptors‐ligands are aligned with the MD binding interaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,286
Score d'incertitude au seuil0,715

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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