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Enregistrement W4226209872 · doi:10.1097/olq.0000000000001493

Frequency and Correlates of Mycoplasma genitalium Antimicrobial Resistance Mutations and Their Association With Treatment Outcomes: Findings From a National Sentinel Surveillance Pilot in England

2021· article· en· W4226209872 sur OpenAlexaff
Helen Fifer, Rachel Merrick, Rachel Pitt, Mandy Yung, Hester Allen, Michaela Day, Katy Sinka, Neil Woodford, Hamish Mohammed, Colin Brown, Gwenda Hughes, Michelle Cole

Notice bibliographique

RevueSexually Transmitted Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensMinnow Environmental (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMycoplasma genitaliumMedicineAzithromycinOdds ratioInternal medicineDrug resistanceConfidence intervalAntibiotic resistanceMen who have sex with menChlamydia trachomatisVirologyMicrobiologyAntibioticsBiologySyphilisHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Mycoplasma genitalium infection is a public health concern due to extensive antimicrobial resistance. Using data from a pilot of M. genitalium antimicrobial resistance surveillance, we determined the prevalence and risk factors for resistance among specimens from sexual health clinic attendees and assessed treatment outcomes. Methods Seventeen sexual health clinics in England sent consecutive M. genitalium –positive specimens to the national reference laboratory from January to March 2019. Regions of the 23S rRNA, parC , and gyrA genes associated with macrolide and fluoroquinolone resistance, respectively, were amplified and sequenced where appropriate. Fisher exact tests, and univariate and multivariable logistic regression models were used to determine associations between demographic, clinical, and behavioral factors and resistance-associated mutations. Results More than two-thirds (173 of 249 [69%]) of M. genitalium specimens had mutations associated with macrolide resistance, whereas predicted fluoroquinolone (21 of 251 [8%]) and dual-drug (12 of 237 [5%]) resistance were less prevalent. No specimens had both gyrA and parC resistance-associated mutations. Macrolide resistance was more common in specimens from men who have sex with men compared with heterosexual men (adjusted odds ratio, 2.64; 95% confidence interval, 1.09–6.38; P = 0.03). There was an association between both macrolide and fluoroquinolone resistance and having a previous sexually transmitted infection ( P = 0.06). Only 19% of individuals returned for a test of cure. Of those infected with a macrolide-resistant genotype who were given azithromycin, 57 of 78 (73%) were known or assumed to be clinically cured; however, 43 of these 57 (75%) also received doxycycline. Of the 21 with a macrolide-resistant genotype who failed treatment, 18 of 21 (86%) also received doxycycline. Conclusions Although macrolide resistance was widespread, particularly among specimens from men who have sex with men and those with a previous sexually transmitted infection diagnosis in the past year, resistance-associated mutations in M. genitalium did not seem to be unequivocally predictive of treatment failure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,129
Score d'incertitude au seuil0,545

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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