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Enregistrement W4226313612 · doi:10.1093/braincomms/fcac085

Differentiating amyloid beta spread in autosomal dominant and sporadic Alzheimer’s disease

2022· article· en· W4226313612 sur OpenAlexaff
Elizabeth Levitis, Jacob W Vogel, Thomas Funck, Vladimir Hachinski, Serge Gauthier, Jonathan Vöglein, Johannes Levin, Brian A. Gordon, Tammie L.S. Benzinger, Yasser Iturria‐Medina, Alan C. Evans

Notice bibliographique

RevueBrain Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensWestern UniversityMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institutes of Health
Mots-clésDiseaseAlzheimer's diseaseAmyloid (mycology)Amyloid betaPresenilinBETA (programming language)NeurosciencePathologyMedicineBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Amyloid-beta deposition is one of the hallmark pathologies in both sporadic Alzheimer’s disease and autosomal-dominant Alzheimer’s disease, the latter of which is caused by mutations in genes involved in amyloid-beta processing. Despite amyloid-beta deposition being a centrepiece to both sporadic Alzheimer’s disease and autosomal-dominant Alzheimer’s disease, some differences between these Alzheimer’s disease subtypes have been observed with respect to the spatial pattern of amyloid-beta. Previous work has shown that the spatial pattern of amyloid-beta in individuals spanning the sporadic Alzheimer’s disease spectrum can be reproduced with high accuracy using an epidemic spreading model which simulates the diffusion of amyloid-beta across neuronal connections and is constrained by individual rates of amyloid-beta production and clearance. However, it has not been investigated whether amyloid-beta deposition in the rarer autosomal-dominant Alzheimer’s disease can be modelled in the same way, and if so, how congruent the spreading patterns of amyloid-beta across sporadic Alzheimer’s disease and autosomal-dominant Alzheimer’s disease are. We leverage the epidemic spreading model as a data-driven approach to probe individual-level variation in the spreading patterns of amyloid-beta across three different large-scale imaging datasets (2 sporadic Alzheimer’s disease, 1 autosomal-dominant Alzheimer’s disease). We applied the epidemic spreading model separately to the Alzheimer’s Disease Neuroimaging initiative (n = 737), the Open Access Series of Imaging Studies (n = 510) and the Dominantly Inherited Alzheimer’s Network (n = 249), the latter two of which were processed using an identical pipeline. We assessed inter- and intra-individual model performance in each dataset separately and further identified the most likely subject-specific epicentre of amyloid-beta spread. Using epicentres defined in previous work in sporadic Alzheimer’s disease, the epidemic spreading model provided moderate prediction of the regional pattern of amyloid-beta deposition across all three datasets. We further find that, whilst the most likely epicentre for most amyloid-beta–positive subjects overlaps with the default mode network, 13% of autosomal-dominant Alzheimer’s disease individuals were best characterized by a striatal origin of amyloid-beta spread. These subjects were also distinguished by being younger than autosomal-dominant Alzheimer’s disease subjects with a default mode network amyloid-beta origin, despite having a similar estimated age of symptom onset. Together, our results suggest that most autosomal-dominant Alzheimer’s disease patients express amyloid-beta spreading patterns similar to those of sporadic Alzheimer’s disease, but that there may be a subset of autosomal-dominant Alzheimer’s disease patients with a separate, striatal phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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