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Enregistrement W4226463294 · doi:10.7554/elife.70494.sa2

Author response: From Gondwana to the Yellow Sea, evolutionary diversifications of true toads Bufo sp. in the Eastern Palearctic and a revisit of species boundaries for Asian lineages

2021· peer-review· en· W4226463294 sur OpenAlexaff
Siti N. Othman, Spartak N. Litvinchuk, Irina V. Maslova, Hollis A. Dahn, Kevin R. Messenger, Desiree Andersen, Michael J. Jowers, Yosuke Kojima, Dmitry V. Skorinov, Kiyomi Yasumiba, Ming‐Feng Chuang, Yi‐Huey Chen, Yoonhyuk Bae, Jennifer Hoti, Yikweon Jang, Amaël Borzée

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAmphibian and Reptile Biology
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGondwanaBufoBiologyGeographyEcologyZoologyPaleontologyToad

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The east Asian Asiatic toad (also known by the latin name Bufo gargarizans) lives in a wide range of habitats across East Asia including forests, meadows and cultivated land. However, it remains unclear how these toads evolved and became so widespread – partly because it has proved difficult for researchers to clearly define the species and what distinguishes it from other closely-related species of toads (collectively known as Bufo toads). Othman et al. combined several bioinformatics techniques to study Asiatic toads and 38 other species of bufonid toads from across the globe. This approach found that Bufo toads first emerged in eastern Asia between 14 and 10 million years ago. This coincides with a point in time when large swathes of land in central Asia turned from adequate to sustain toad populations into desert, suggesting the change in climate prompted the toads to migrate eastwards from central Asia. The Bufo toads then divided into two groups of species: one in mainland East Asia and the other in Japan. Furthermore, the study revealed there is more genetic diversity – that is, more variety in the DNA of individuals – in Asiatic toads than previously thought. The findings also help to define several other species of Bufo toads more clearly and describe a new toad species restricted to the Korean Peninsula, northeastern China and the Russian Primorye region: the Sakhalin toad (Bufo sachalinensis). This work demonstrates that a large-scale study of many species across the globe can be used to understand how the species evolved and more clearly distinguish one species from another. The findings of Othman et al. will be of interest to both professional and citizen scientists interested in the natural history of Asia. Furthermore, as several species of Bufo toads are in decline in the wild, they provide evidence that may aid future efforts to conserve them.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,237
Score d'incertitude au seuil0,793

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2370,063

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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