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Enregistrement W4228996911 · doi:10.1098/rspb.2022.0670

Thermal regime during parental sexual maturation, but not during offspring rearing, modulates DNA methylation in brook charr ( <i>Salvelinus fontinalis</i> )

2022· article· en· W4228996911 sur OpenAlexafffund
Clare J. Venney, Kyle W. Wellband, Éric Normandeau, Carolyne Houle, Dany Garant, Céline Audet, Louis Bernatchez

Notice bibliographique

RevueProceedings of the Royal Society B Biological Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversité du Québec à RimouskiUniversité de SherbrookeUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSalvelinusOffspringBiologyDNA methylationEpigeneticsGeneticsContext (archaeology)EcologyZoologyGenePregnancyTroutGene expressionFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetic inheritance can result in plastic responses to changing environments being faithfully transmitted to offspring. However, it remains unclear how epigenetic mechanisms such as DNA methylation can contribute to multigenerational acclimation and adaptation to environmental stressors. Brook charr ( Salvelinus fontinalis ), an economically important salmonid, is highly sensitive to thermal stress and is of conservation concern in the context of climate change. We studied the effects of temperature during parental sexual maturation and offspring rearing on whole-genome DNA methylation in brook charr juveniles (fry). Parents were split between warm and cold temperatures during sexual maturation, mated in controlled breeding designs, then offspring from each family were split between warm (8°C) and cold (5°C) rearing environments. Using whole-genome bisulfite sequencing, we found 188 differentially methylated regions (DMRs) due to parental maturation temperature after controlling for family structure. By contrast, offspring rearing temperature had a negligible effect on offspring methylation. Stable intergenerational inheritance of DNA methylation and minimal plasticity in progeny could result in the transmission of acclimatory epigenetic states to offspring, priming them for a warming environment. Our findings have implications pertaining to the role of intergenerational epigenetic inheritance in response to ongoing climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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