MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4229005685 · doi:10.1093/plphys/kiac214

EXTRA LARGE G-PROTEIN2 mediates cell death and hyperimmunity in the <i>chitin elicitor receptor kinase 1-4</i> mutant

2022· article· en· W4229005685 sur OpenAlexfundno aff
Elena Petutschnig, Julia Anders, Marnie Stolze, Christopher Meusel, Ronja Hacke, Laura Much, Melina Schwier, Anna-Lena Gippert, Samuel Kroll, Patrick Faßhauer, Marcel Wiermer, Volker Lipka

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBiologyElicitorCell biologyArabidopsisSignal transductionMutantGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heterotrimeric G-proteins are signal transduction complexes that comprised three subunits, Gα, Gβ, and Gγ, and are involved in many aspects of plant life. The noncanonical Gα subunit EXTRA LARGE G-PROTEIN2 (XLG2) mediates pathogen-associated molecular pattern (PAMP)-induced reactive oxygen species (ROS) generation and immunity downstream of pattern recognition receptors. A mutant of the chitin receptor component CHITIN ELICITOR RECEPTOR KINASE1 (CERK1), cerk1-4, maintains normal chitin signaling capacity but shows excessive cell death upon infection with powdery mildew fungi. We identified XLG2 mutants as suppressors of the cerk1-4 phenotype. Mutations in XLG2 complex partners ARABIDOPSIS Gβ1 (AGB1) and Gγ1 (AGG1) have a partial cerk1-4 suppressor effect. Contrary to its role in PAMP-induced immunity, XLG2-mediated control of ROS production by RESPIRATORY BURST OXIDASE HOMOLOGUE D (RBOHD) is not critical for cerk1-4-associated cell death and hyperimmunity. The cerk1-4 phenotype is also independent of the co-receptor/adapter kinases BRI1-ASSOCIATED RECEPTOR KINASE 1 (BAK1) and SUPPRESSOR OF BIR1 1 (SOBIR1), but requires the E3 ubiquitin ligase PLANT U-BOX 2 (PUB2). XLG2 localizes to both the cell periphery and nucleus, and the cerk1-4 cell death phenotype is mediated by the cell periphery pool of XLG2. Integrity of the XLG2 N-terminal domain, but not its phosphorylation, is essential for correct XLG2 localization and formation of the cerk1-4 phenotype. Our results support a model in which XLG2 acts downstream of an unknown cell surface receptor that activates an NADPH oxidase-independent cell death pathway in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLANT PHYSIOLOGYMême sujetPlant-Microbe Interactions and ImmunityTravaux en français237 207