MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4229010901 · doi:10.1111/nph.18203

A trait–environment relationship approach to participatory plant breeding for organic agriculture

2022· article· en· W4229010901 sur OpenAlexafffundabout
Andrés G. Rolhauser, Emma Windfeld, Solveig Hanson, Hannah Wittman, Chris Thoreau, Alexandra Lyon, Marney E. Isaac

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of CalgaryKwantlen Polytechnic UniversityThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTraitAgronomyBiologyCropPetiole (insect anatomy)AgricultureCrop yieldGene–environment interactionEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary The extent of intraspecific variation in trait–environment relationships is an open question with limited empirical support in crops. In organic agriculture, with high environmental heterogeneity, this knowledge could guide breeding programs to optimize crop attributes. We propose a three‐dimensional framework involving crop performance, crop traits, and environmental axes to uncover the multidimensionality of trait–environment relationships within a crop. We modeled instantaneous photosynthesis (Asat) and water‐use efficiency (WUE) as functions of four phenotypic traits, three soil variables, five carrot (Daucus carota) varieties, and their interactions in a national participatory plant breeding program involving a suite of farms across Canada. We used these interactions to describe the resulting 12 trait–environment relationships across varieties. We found one significant trait–environment relationship for Asat (taproot tissue density–soil phosphorus), which was consistent across varieties. For WUE, we found that three relationships (petiole diameter–soil nitrogen, petiole diameter–soil phosphorus, and leaf area–soil phosphorus) varied significantly across varieties. As a result, WUE was maximized by different combinations of trait values and soil conditions depending on the variety. Our three‐dimensional framework supports the identification of functional traits behind the differential responses of crop varieties to environmental variation and thus guides breeding programs to optimize crop attributes from an eco‐evolutionary perspective.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNew PhytologistMême sujetEcology and Vegetation Dynamics StudiesTravaux en français237 207