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Enregistrement W4229028033 · doi:10.1101/2022.05.03.490497

The Systematic Optimization of Square Wave Electroporation for Six Commonly Used Human Cell Lines

2022· preprint· en· W4229028033 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Inactivation Methods
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésElectroporationElectric fieldVoltageSquare wavePulse (music)Materials scienceCell cultureViability assayTransfectionBiomedical engineeringBiophysicsBiological systemAnalytical Chemistry (journal)ChemistryBiologyElectrical engineeringGeneticsChromatographyPhysicsGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract During cellular electroporation, the formation of transient pores allow for the diffusion of innately impermeable molecules. The diversity of cell and membrane structure results in unique properties with respect to sensitivity to electric fields. The growing use of human cell lines in biomedical research and technology has led to a demand for protocols that can effectively and economically perform electroporation. We electroporated six human cell lines using a fluorescent reporter to investigate the effects of pulse electric field strength, pulse duration, and DNA concentration during electroporation. It was found that the cell lines all responded to electric field strengths within 400-950V/cm with viability decreasing with increasing voltage. It was also observed that the concentration of DNA used directly impacts transfection efficiency and cell viability as well. To better characterize square wave electroporation, we adopted a model where the pulse is described by its energy density (J/L) with respect to the sample buffer volume. It was determined that the key electrical characteristics of electroporation can be generalized with this value to provide a simplified measure of pulse intensity. The resulting analysis was consistent with other models, indicating cell type specific optimal electrical and DNA concentrations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,178
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle