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Enregistrement W4229030223 · doi:10.1038/s41467-022-30015-1

Heterozygous frameshift variants in HNRNPA2B1 cause early-onset oculopharyngeal muscular dystrophy

2022· article· en· W4229030223 sur OpenAlexaff
Hong Joo Kim, Payam Mohassel, Sandra Donkervoort, Lin Guo, Kevin O’Donovan, Maura Coughlin, Xavière Lornage, Nicola Foulds, Simon Hammans, A. Reghan Foley, Charlotte M. Fare, Alice F. Ford, Masashi Ogasawara, Aki Sato, Aritoshi Iida, Pinki Munot, Gautam Ambegaonkar, Rahul Phadke, Dominic G. O’Donovan, Rebecca Buchert, Mona Grimmel, Ana Töpf, Irina Zaharieva, Lauren Brady, Ying Hu, Thomas E. Lloyd, Andrea Klein, Maja Steinlin, Alice Kuster, Sandra Mercier, Pascale Marcorelles, Yann Péréon, Emmanuelle Fleurence, Adnan Manzur, Sarah Ennis, Rosanna Upstill‐Goddard, Luca Bello, Cinzia Bertolin, Elena Pegoraro, Leonardo Salviati, Courtney E. French, Andriy Shatillo, F. Lucy Raymond, Tobias B. Haack, Susana Quijano‐Roy, Johann Böhm, Isabelle Nelson, Tanya Stojkovic, Teresinha Evangelista, Volker Straub, Norma B. Romero, Jocelyn Laporte, Francesco Muntoni, Ichizo Nishino, Mark A. Tarnopolsky, James Shorter, Carsten G. Bönnemann, J. Paul Taylor

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensMcMaster UniversityHamilton Health SciencesHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesNIH Clinical CenterNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilSanofi GenzymeUniversity College LondonTarget ALSGreat Ormond Street Hospital for ChildrenKurt+Peter FoundationNational Eye InstituteNational Center of Neurology and PsychiatryFondation Maladies RaresNational Human Genome Research InstituteUltragenyx PharmaceuticalAlzheimer's AssociationLimb Girdle Muscular Dystrophy 2INational Institute on AgingUniversity of TokushimaNational Institute for Health and Care ResearchMassachusetts General HospitalNational Institutes of HealthRosetrees TrustNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchSanofiBroad InstituteLimb Girdle Muscular Dystrophy 2i Research FundJapan Agency for Medical Research and DevelopmentALS AssociationEllison Medical FoundationU.S. Department of Health and Human ServicesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésOculopharyngeal muscular dystrophyFrameshift mutationMuscular dystrophyGeneticsMedicineBiologyMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Missense variants in RNA-binding proteins (RBPs) underlie a spectrum of disease phenotypes, including amyotrophic lateral sclerosis, frontotemporal dementia, and inclusion body myopathy. Here, we present ten independent families with a severe, progressive muscular dystrophy, reminiscent of oculopharyngeal muscular dystrophy (OPMD) but of much earlier onset, caused by heterozygous frameshift variants in the RBP hnRNPA2/B1. All disease-causing frameshift mutations abolish the native stop codon and extend the reading frame, creating novel transcripts that escape nonsense-mediated decay and are translated to produce hnRNPA2/B1 protein with the same neomorphic C-terminal sequence. In contrast to previously reported disease-causing missense variants in HNRNPA2B1 , these frameshift variants do not increase the propensity of hnRNPA2 protein to fibrillize. Rather, the frameshift variants have reduced affinity for the nuclear import receptor karyopherin β2, resulting in cytoplasmic accumulation of hnRNPA2 protein in cells and in animal models that recapitulate the human pathology. Thus, we expand the phenotypes associated with HNRNPA2B1 to include an early-onset form of OPMD caused by frameshift variants that alter its nucleocytoplasmic transport dynamics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,131
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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