Identification of sex-determining loci in hybridizing <i>Catostomus</i> fish species
Notice bibliographique
Résumé
1 Abstract Despite the near-universality of gonochorism (separate sexes) in eukaryotic organisms, the underlying mechanisms of sex determination are poorly understood and highly variable in some taxa. Sex determination mechanisms may promote or impede reproductive isolation depending on whether mechanisms are similar between related species, so identifying genomic regions associated with sex determination is especially relevant for understanding evolutionary diversification and hybridization between closely related species. In Catostomus fishes, contemporary hybridization is variable and extensive, but factors influencing hybridization dynamics are not fully understood. In the present study, we aim to describe the genetic basis of sex determination in bluehead ( Catostomus discobolus ) and white suckers ( Catostomus commersonii ) to understand the potential impact of sex determination on reproductive isolation. We used genotyping-by-sequencing data from Catostomus species and their hybrids to identify regions of the genome associated with sex using a genome-wide association study and the identification of sex-specific loci. We identified a genetic basis of sex determination in Catostomus fishes, with a region of the genome significantly associating with sex in bluehead suckers. This region is suggestive of a master sex-determining region in bluehead suckers but is not significant in white suckers, implying that either the sex-determining region of the genome differs in these two species that hybridize, or that sample size was insufficient to identify this genomic region in white suckers. By describing and comparing sex-determination systems across Catostomus fish species, we highlight the relationship between sex determining systems and hybridization in closely related fish species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».