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Enregistrement W4229069908 · doi:10.1016/j.ymthe.2022.04.025

Identification of FDA-approved bifonazole as a SARS-CoV-2 blocking agent following a bioreporter drug screen

2022· article· en· W4229069908 sur OpenAlexafffund
Zaid Taha, Rozanne Arulanandam, Glib Maznyi, Elena Godbout, Madalina E. Carter-Timofte, Naziia Kurmasheva, Line S. Reinert, Andrew Chen, Mathieu J. F. Crupi, Stephen Boulton, Geneviève Laroche, Alexandra Phan, Reza Rezaei, Nouf Alluqmani, Anna Jirovec, Alexandra Acal, Emily E.F. Fekete, Ragunath Singaravelu, Julia Petryk, Manja Idorn, Kyle Potts, Hayley Todesco, Cini Mathew John, Douglas J. Mahoney, Carolina S. Ilkow, Patrick M. Giguère, Tommy Alain, Marceline Côté, Søren R. Paludan, David Olagnier, John C. Bell, Taha Azad, Jean‐Simon Diallo

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of CalgaryChildren's Hospital of Eastern OntarioOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesInstitute of Infection and ImmunityOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaKing Faisal Specialist Hospital and Research CentreDanmarks Frie ForskningsfondCanadian Institutes of Health ResearchEuropean Research CouncilMitacsSundhedsvidenskabelige Fakultet, Aarhus UniversitetOntario Institute for Cancer ResearchLundbeckfondenHørslev-FondenH2020 European Research CouncilHartmann FondenNovo Nordisk FondenKræftens Bekæmpelse
Mots-clésBlocking (statistics)DrugSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)VirologyPharmacologyIdentification (biology)2019-20 coronavirus outbreakChemistryMedicineBiologyComputer scienceInternal medicineInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We established a split nanoluciferase complementation assay to rapidly screen for inhibitors that interfere with binding of the receptor binding domain (RBD) of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spike glycoprotein with its target receptor, angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2). After a screen of 1,200 US Food and Drug Administration (FDA)-approved compounds, we identified bifonazole, an imidazole-based antifungal agent, as a competitive inhibitor of RBD-ACE2 binding. Mechanistically, bifonazole binds ACE2 around residue K353, which prevents association with the RBD, affecting entry and replication of spike-pseudotyped viruses as well as native SARS-CoV-2 and its variants of concern (VOCs). Intranasal administration of bifonazole reduces lethality in K18-hACE2 mice challenged with vesicular stomatitis virus (VSV)-spike by 40%, with a similar benefit after live SARS-CoV-2 challenge. Our screen identified an antiviral agent that is effective against SARS-CoV-2 and VOCs such as Omicron that employ the same receptor to infect cells and therefore has high potential to be repurposed to control, treat, or prevent coronavirus disease 2019 (COVID-19).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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