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Enregistrement W4229070974 · doi:10.2196/34757

Impact of COVID-19 Social Distancing Mandates on Gastrointestinal Pathogen Positivity: Secondary Data Analysis

2022· article· en· W4229070974 sur OpenAlexvenueno aff
Tanner Palmer, L. Scott Benson, Christina A. Porucznik, Lisa H. Gren

Notice bibliographique

RevueJMIR Public Health and Surveillance · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfection Control and Ventilation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBioFire Diagnostics
Mots-clésSocial distanceNorovirusTransmission (telecommunications)Airborne transmissionMedicinePandemicEnvironmental healthCoronavirus disease 2019 (COVID-19)VirologyOutbreakInfectious disease (medical specialty)Internal medicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Acute gastrointestinal (GI) illnesses are of the most common problems evaluated by physicians and some of the most preventable. There is evidence of GI pathogen transmission when people are in close contact. The COVID-19 pandemic led to the sudden implementation of widespread social distancing measures in the United States. There is strong evidence that social distancing measures impact the spread of SARS-CoV-2, and a growing body of research indicates that these measures also decrease the transmission of other respiratory pathogens. OBJECTIVE: This study aims to investigate the impact of COVID-19 social distancing mandates on the GI pathogen positivity rates. METHODS: Deidentified GI Panel polymerase chain reaction test results from a routinely collected diagnostic database from January 1, 2019, through August 31, 2020, were analyzed for the GI pathogen positivity percentage. An interrupted time series analysis was performed, using social distancing mandate issue dates as the intervention date. The following 3 target organisms were chosen for the final analysis to represent different primary transmission routes: adenovirus F40 and 41, norovirus GI and GII, and Escherichia coli O157. RESULTS: In total, 84,223 test results from 9 states were included in the final data set. With the exception of E coli O157 in Kansas, Michigan, and Nebraska, we observed an immediate decrease in positivity percentage during the week of social distancing mandates for all other targets and states. Norovirus GI and GII showed the most notable drop in positivity, whereas E coli O157 appeared to be least impacted by social distancing mandates. Although we acknowledge the analysis has a multiple testing problem, the majority of our significant results showed significance even below the .01 level. CONCLUSIONS: This study aimed to investigate the impact of social distancing mandates for COVID-19 on GI pathogen positivity, and we discovered that social distancing measures in fact decreased GI pathogen positivity initially. The use of similar measures may prove useful in GI pathogen outbreaks. The use of a unique diagnostic database in this study exhibits the potential for its use as a public health surveillance tool.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,389

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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