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Enregistrement W4229082241 · doi:10.1016/j.eswa.2022.117330

Seizure localisation with attention-based graph neural networks

2022· article· en· W4229082241 sur OpenAlexaff
Daniele Grattarola, Lorenzo Livi, Cesare Alippi, Richard Wennberg, Taufik A. Valiante

Notice bibliographique

RevueExpert Systems with Applications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueEEG and Brain-Computer Interfaces
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity of TorontoOntario Brain InstituteUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésIctalComputer scienceArtificial intelligenceRobustness (evolution)EpilepsyElectroencephalographyArtificial neural networkFunctional connectivityPattern recognition (psychology)GraphMachine learningNeurosciencePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this paper, we introduce a machine learning methodology for localising the seizure onset zone in subjects with epilepsy. We represent brain states as functional networks obtained from intracranial electroencephalography recordings, using correlation and the phase-locking value to quantify the coupling between different brain areas. Our method is based on graph neural networks (GNNs) and the attention mechanism, two of the most significant advances in artificial intelligence in recent years. Specifically, we train a GNN to distinguish between functional networks associated with interictal and ictal phases. The GNN is equipped with an attention-based layer that automatically learns to identify those regions of the brain (associated with individual electrodes) that are most important for a correct classification. The localisation of these regions does not require any prior information regarding the seizure onset zone. We show that the regions of interest identified by the GNN strongly correlate with the localisation of the seizure onset zone reported by electroencephalographers. We report results both for human patients and for simulators of brain activity. We also show that our GNN exhibits uncertainty for those patients for which the clinical localisation was unsuccessful, highlighting the robustness of the proposed approach.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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