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Enregistrement W4229367230 · doi:10.1183/23120541.lsc-2022.116

Generation of apical-out airway organoids from human primary airway epithelial cells

2022· article· en· W4229367230 sur OpenAlexaff
Georgios Stroulios, Tyler Brown, Douglas Kondro, Alessandro Dei, Allen Eaves, Sharon A. Louis, Juan Hou, Wing Y. Chang, Salvatore Simmini

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Respiratory Health Research
Établissements canadiensStemcell Technologies
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOrganoidCell biologyEpitheliumCiliumAirwayCell cultureRespiratory epitheliumExtracellular matrixIn vivoBiologyCellChemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Airway organoids can be successfully generated from primary airway epithelial cells, recapitulating the architecture, polar organization, and key functions of the in vivo tissue. However, the closed organoid structure limits the accessibility to the luminal apical cell surface, which is exposed to the environment in vivo. This inaccessibility hinders the utilization of airway organoids in assays examining host-pathogen interactions and responses to environmental stimuli, both of which occur primarily at the apical surface. To address this limitation, we have developed PneumaCult™ Apical-Out Airway Organoid (AOAO) Medium, which supports the fast and efficient generation of airway organoids exposing their apical side to the environment in the absence of an extracellular matrix hydrogel. To generate AOAOs, two-dimensional expanded human bronchial epithelial cells (HBECs) were seeded in PneumaCult™ AOAO Medium in micropatterned [AggreWell™400] plates to promote cell aggregation. The aggregates were then transferred to suspension culture in fresh PneumaCult™ AOAO, and incubated at 37°C until they differentiated into AOAOs. These organoids can be generated from HBECs from a multitude of different passages and display high culture homogeneity, with low inter-donor size variability (average diameter 74 ± 4 μm at p3, n=3). The organoids are mainly composed of ciliated cells (61 ± 16% of all cells at p3) that display outward-facing, beating cilia and KRT5-positive basal cells (n=3). The easy access to the apical surface of the epithelium and scalability of this culture system offer a powerful in vitro model suitable for studying host-pathogen interactions and high-throughput antiviral drug screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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