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Enregistrement W4229367362 · doi:10.3389/fneur.2022.826564

Lifespan Volume Trajectories From Non–harmonized T1–Weighted MRI Do Not Differ After Site Correction Based on Traveling Human Phantoms

2022· article· en· W4229367362 sur OpenAlexafffund
Sarah Treit, Emily Stolz, Julia N. Rickard, Cheryl R. McCreary, Mercedes Bagshawe, Richard Frayne, Catherine Lebel, Derek Emery, Christian Beaulieu

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neurology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalFoothills Medical CentreUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésImaging phantomPutamenWhite matterBrain sizeScannerGlobus pallidusNuclear medicineVoxelPsychologyMagnetic resonance imagingArtificial intelligenceComputer scienceNeuroscienceMedicineBasal gangliaRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multi-site imaging consortiums strive to increase participant numbers by pooling data across sites, but scanner related differences can bias results. This study combines data from three research MRI centers, including three different scanner models from two vendors, to examine non-harmonized T1-weighted brain imaging protocols in two cohorts. First, 23 human traveling phantoms were scanned twice each at all three sites (six scans per person; 138 scans total) to quantify within-participant variability of brain volumes (total brain, white matter, gray matter, lateral ventricles, thalamus, caudate, putamen and globus pallidus), and to calculate site-specific correction factors for each structure. Sample size calculations were used to determine the number of traveling phantoms needed to achieve effect sizes for observed differences to help guide future studies. Next, cross-sectional lifespan volume trajectories were examined in 856 healthy participants (5-91 years of age) scanned at these sites. Cross-sectional trajectories of volume versus age for each structure were then compared before and after application of traveling phantom based site-specific correction factors, as well as correction using the open-source method ComBat. Although small systematic differences between sites were observed in the traveling phantom analysis, correction for site using either method had little impact on the lifespan trajectories. Only white matter had small but significant differences in the intercept parameter after ComBat correction (but not traveling phantom based correction), while no other fits differed. This suggests that age-related changes over the lifespan outweigh systematic differences between scanners for volumetric analysis. This work will help guide pooling of multisite datasets as well as meta-analyses of data from non-harmonized protocols.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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