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Enregistrement W4229376779 · doi:10.1038/s41598-022-12064-0

Author Correction: High-throughput identification of viral termini and packaging mechanisms in virome datasets using PhageTermVirome

2022· erratum· en· W4229376779 sur OpenAlexafffund
Julian R. Garneau, Véronique Legrand, Martial Marbouty, Maximilian O. Press, Dean Vik, Louis‐Charles Fortier, Matthew B. Sullivan, David Bikard, Marc Monot

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typeerratum
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la RechercheFP7 Research infrastructuresNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInfrastructures en Biologie Santé et Agronomie
Mots-clésHuman viromeIdentification (biology)ThroughputComputational biologyComputer scienceBiologyGeneticsMetagenomicsGeneOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

“This work was supported by the French Government’s program Investissement d’Avenir program; Laboratoire d’Excellence ‘Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases’ [ANR-10-LABX-62-IBEID] and the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC #341450-2010). Biomics Platform, C2RT, Institut Pasteur, Paris, France, is supported by France Génomique (ANR-10-INBS-09-09) and the Infrastructures de recherche en biologie, santé et agronomie (IBISA).”

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,085
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil0,247

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,085
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0040,002
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0050,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0740,048

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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