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Enregistrement W4229453280 · doi:10.1038/s41467-022-30227-5

Serum metabolome associated with severity of acute traumatic brain injury

2022· article· en· W4229453280 sur OpenAlexaff
Ilias Thomas, Alex M. Dickens, Jussi P. Posti, Endre Czeiter, Daniel Duberg, Tim Sinioja, Matilda Kråkström, Isabel R. A. Retel Helmrich, Kevin Wang, Andrew I.R. Maas, Ewout W. Steyerberg, David Menon, Olli Tenovuo, Tuulia Hyötyläinen, András Büki, Matej Orešič, Cecilia Åkerlund, Krisztina Amrein, Nada Anđelić, Lasse Andreassen, Audny Anke, Anna Antoni, Gérard Audibert, Philippe Azouvi, Maria Luisa Azzolini, Ronald Bartels, Pál Barzó, Romuald Beauvais, Ronny Beer, Bo‐Michael Bellander, Antonio Belli, Habib Benali, Maurizio Berardino, Luigi Beretta, Morten Blaabjerg, Peter Bragge, Alexandra Bražinová, Vibeke Brinck, Joanne Brooker, Camilla Brorsson, Monika Bullinger, Manuel Cabeleira, Alessio Caccioppola, Emiliana Calappi, Maria Rosa Calvi, Peter Cameron, Guillermo Carbayo Lozano, Marco Carbonara, Simona Cavallo, Giorgio Chevallard, Arturo Chieregato, Giuseppe Citerio, Hans Clusmann, Mark Coburn, Jonathan Coles, Marta Correia, Amra Čović, Nicola Curry, Marek Czosnyka, Claire Dahyot‐Fizelier, Paul Dark, Helen Dawes, Véronique De Keyser, Vincent Degos, Françesco Della Corte, Hugo den Boogert, Bart Depreitere, Đula Đilvesi, Abhishek Dixit, Emma Donoghue, Jens P. Dreier, Guy‐Loup Dulière, Ari Ercole, Patrick Esser, Erzsébet Ezer, Martin Fabricius, Valery L. Feigin, Kelly Foks, Shirin Frisvold, Alex Furmanov, Pablo Gagliardo, Damien Galanaud, Dashiell Gantner, Guoyi Gao, Pradeep George, Alexandre Ghuysen, Lelde Giga, Ben Glocker, Jagoš Golubović, Pedro A. Gómez, Johannes Gratz, Benjamin Gravesteijn, Francesca Grossi, Russell L. Gruen, Deepak Gupta, Juanita A. Haagsma, Iain Haitsma, Raimund Helbok, Eirik Helseth, Lindsay Horton, Jilske Huijben, Peter J. Hutchinson, Bram Jacobs, Stefan Jankowski, Mike Jarrett, Jiyao Jiang, Faye Johnson, Kelly Jones, Mladen Karan, Angelos G. Kolias, Erwin J. O. Kompanje, Daniel Kondziella, Evgenios Kornaropoulos, Lars‐Owe Koskinen, Noémi Kovács, Ana Kowark, Alfonso Lagares, Linda Lanyon, Steven Laureys, Fiona Lecky, Didier Ledoux, Rolf Lefering, Valérie Legrand, Aurélie Lejeune, Leon Levi, Roger Lightfoot, Hester F. Lingsma, Ana M. Castaño‐León, Marc Maegele, Marek Majdán, Alex Manara, Geoffrey T. Manley, Costanza Martino, Hugues Maréchal, Julia Mattern, Catherine McMahon, Béla Melegh, Tomas Menovsky, Ana Mikolić, Benoît Misset, Visakh Muraleedharan, Lynnette Murray, Ancuța Negru, David Nelson, Virginia Newcombe, Daan Nieboer, József Nyirádi, Otesile Olubukola, Fabrizio Ortolano, Aarno Palotie, Paul M. Parizel, Jean‐François Payen, Natascha Perera, Vincent Perlbarg, Paolo Persona, Wilco C. Peul, Anna Piippo-Karjalainen, Matti Pirinen, Horia Pleș, Suzanne Polinder, Iñigo Pomposo, Louis Puybasset, Andreea Rădoi, Arminas Ragauskas, Rahul Raj, Malinka Rambadagalla, Jonathan R. Rhodes, Sylvia Richardson, Sophie Richter, Samuli Ripatti, Saulius Ročka, Cecilie Røe, Olav Røise, Jonathan Rosand, Jeffrey V. Rosenfeld, Christina Rosenlund, Guy Rosenthal, Rolf Rossaint, Sandra Rossi, Daniel Rueckert, Martin Rusňák, Juan Sahuquillo, Oliver Sakowitz, Renán Sánchez-Porras, János Sándor, Nadine Schäfer, Silke Schmidt, Herbert Schöechl, Guus Schoonman, Rico Frederik Schou, Elisabeth Schwendenwein, Charlie Sewalt, Toril Skandsen, Peter Smielewski, Abayomi Sorinola, Emmanuel A. Stamatakis, Simon Stanworth, Robert D. Stevens, William Stewart, Nino Stocchetti, Nina Sundström, Riikka Takala, Viktória Tamás, Tomas Tamošuitis, Mark Taylor, Braden Te Ao, Alice Theadom, Matt Thomas, Dick Tibboel, Marjolein Timmers, Christos Tolias, Tony Trapani, Cristina Maria Tudora, Andreas Unterberg, Peter Vajkoczy, Shirley Vallance, Egils Valeinis, Zoltán Vámos, Mathieu van der Jagt, Gregory Van der Steen, Joukje van der Naalt, Jeroen T.J.M. van Dijck, Thomas A. van Essen, Wim Van Hecke, Caroline van Heugten, Dominique Van Praag, Thijs Vande Vyvere, Roel P. J. van Wijk, Alessia Vargiolu, Emmanuel Vega, Kimberley Velt, Jan Verheyden, Paul Vespa, Anne Vik, Rimantas Vilcinis, Victor Volovici, Nicole von Steinbüchel, Daphne Voormolen, Petar Vuleković, Eveline Wiegers, Guy Williams, Lindsay Wilson, Stefan Winzeck, Stefan Wolf, Zhihui Yang, Peter Ylén, Alexander Younsi, Frederick A. Zeiler, Veronika Zelinkova, Agate Ziverte, Tommaso Zoerle

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraumatic Brain Injury and Neurovascular Disturbances
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesVetenskapsrådetÖrebro UniversitetEuropean CommissionAcademy of Medical SciencesAcademy of FinlandNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésTraumatic brain injuryMetabolomeMedicineNeurologyCohortPathophysiologyLipidomeInternal medicineCohort studyBioinformaticsLipid metabolismPsychiatryBiologyMetabolite

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Complex metabolic disruption is a crucial aspect of the pathophysiology of traumatic brain injury (TBI). Associations between this and systemic metabolism and their potential prognostic value are poorly understood. Here, we aimed to describe the serum metabolome (including lipidome) associated with acute TBI within 24 h post-injury, and its relationship to severity of injury and patient outcome. We performed a comprehensive metabolomics study in a cohort of 716 patients with TBI and non-TBI reference patients (orthopedic, internal medicine, and other neurological patients) from the Collaborative European NeuroTrauma Effectiveness Research in Traumatic Brain Injury (CENTER-TBI) cohort. We identified panels of metabolites specifically associated with TBI severity and patient outcomes. Choline phospholipids (lysophosphatidylcholines, ether phosphatidylcholines and sphingomyelins) were inversely associated with TBI severity and were among the strongest predictors of TBI patient outcomes, which was further confirmed in a separate validation dataset of 558 patients. The observed metabolic patterns may reflect different pathophysiological mechanisms, including protective changes of systemic lipid metabolism aiming to maintain lipid homeostasis in the brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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