Host Plant Reaction to Rice Yellow Mottle Virus and Allelic Diversity of RYMV1 Gene in Rice Cultivars in Uganda
Notice bibliographique
Résumé
Rice Yellow Mottle Virus (RYMV) disease is endemic to Africa where it affects rice production. Host plant resistance would form a cost effective and sustainable option for managing the disease. However, there is still lack of knowledge on the reaction of rice germplasm and the genetic basis of their resistance/susceptibility to RYMV coupled with lack of molecular markers to facilitate the development of RYMV resistant varieties. We screened 56 rice accessions drawn from breeding lines and varieties commercially cultivated in Uganda for their resistance/susceptibility to RYMV. We also sought to develop and validate allele specific markers for RYMV1 alleles. The rice accessions showed variation in their reaction to RYMV; 14, 12, 17 and 13 accessions were categorized as resistant, moderately resistant, moderately susceptible and susceptible respectively. Among the resistant accessions, five possessed a single SNP (G/A) corresponding to the rymv1-2 allele. The new accessions can be deployed as resistant cultivars and/or used to introgress rymv1-2 allele into susceptible adapted cultivars throughout Africa. We developed two functional allele specific markers, which co-segregated with the rymv1-2 resistance allele in an F2 population and clearly differentiated between the susceptible and resistant individuals in the F2 population. The functional allele specific marker developed in this study can be used in MAS programs for introgression of rymv1-2 resistance allele.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».