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Enregistrement W4229459713 · doi:10.3233/jad-215289

Data-Driven Analyses of Longitudinal Hippocampal Imaging Trajectories: Discrimination and Biomarker Prediction of Change Classes

2022· article· en· W4229459713 sur OpenAlexafffund
Shannon M. Drouin, G. Peggy McFall, Olivier Potvin, Pierre Bellec, Mario Masellis, Simon Duchesne, Roger A. Dixon

Notice bibliographique

RevueJournal of Alzheimer s Disease · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreInstitut Universitaire de Gériatrie de MontréalUniversité LavalUniversity of AlbertaUniversité de MontréalWomen and Children’s Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthIXICOH. Lundbeck A/SServierAlberta InnovatesEisaiNorthern California Institute for Research and EducationPfizerNovartis Pharmaceuticals CorporationUniversity of Southern CaliforniaBiogenEli Lilly and CompanyBioClinicaU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsNational Institute on AgingConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésBiomarkerContext (archaeology)NeuroimagingAsymptomaticHippocampal formationNeuroscienceInternal medicineMedicinePsychologyBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Hippocampal atrophy is a well-known biomarker of neurodegeneration, such as that observed in Alzheimer's disease (AD). Although distributions of hippocampal volume trajectories for asymptomatic individuals often reveal substantial heterogeneity, it is unclear whether interpretable trajectory classes can be objectively detected and used for prediction analyses. OBJECTIVE: To detect and predict hippocampal trajectory classes in a computationally competitive context using established AD-related risk factors/biomarkers. METHODS: We used biomarker/risk factor and longitudinal MRI data in asymptomatic adults from the AD Neuroimaging Initiative (n = 351; Mean = 75 years; 48.7% female). First, we applied latent class growth analyses to left (LHC) and right (RHC) hippocampal trajectory distributions to identify distinct classes. Second, using random forest analyses, we tested 38 multi-modal biomarkers/risk factors for their relative importance in discriminating the lower (potentially elevated atrophy risk) from the higher (potentially reduced risk) class. RESULTS: For both LHC and RHC trajectory distribution analyses, we observed three distinct trajectory classes. Three biomarkers/risk factors predicted membership in LHC and RHC lower classes: male sex, higher education, and lower plasma Aβ1-42. Four additional factors selectively predicted membership in the lower LHC class: lower plasma tau and Aβ1-40, higher depressive symptomology, and lower body mass index. CONCLUSION: Data-driven analyses of LHC and RHC trajectories detected three classes underlying the heterogeneous distributions. Machine learning analyses determined three common and four unique biomarkers/risk factors discriminating the higher and lower LHC/RHC classes. Our sequential analytic approach produced evidence that the dynamics of preclinical hippocampal trajectories can be predicted by AD-related biomarkers/risk factors from multiple modalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,068

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,222
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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