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Enregistrement W4229541348 · doi:10.32920/ryerson.14652072

Integrins Specifically Associated with the Activated Phagocytic Receptor Complexes from Human U937 Macrophages and the Integrins of Human Blood

2021· preprint· en· W4229541348 sur OpenAlexaff
Jaimie Dufresne

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésScavenger receptorReceptorChemistryPhagocytosisU937 cellIntegrinAffinity chromatographyBiochemistryLigand (biochemistry)Molecular biologyCell biologyBiologyLipoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Receptor complexes are a key locus in the treatment of disease and pain but remain difficult to isolate. The Fc receptor binds to IgG presented on micro particles and triggers phagocytosis that is required for the engulfment of bacteria and non-self, pathogen molecules. Circulating LDL may be converted to oxLDL that is recognized by scavenger or other innate receptors that trigger the production of free radicals and phagocytic engulfment. The Fc receptor complex was captured using its cognate ligand IgG bound to 2 micron polystyrene beads from live cells by live cell affinity receptor chromatography (LARC). Similarly, oxLDL was used to coat micro beads to isolate the oxLDL-scavenger receptor complexes. The ligand coated beads were presented to live human macrophage U937 cells and sampled over the course of cell binding and engulfment in saline experimental medium. The receptor complexes were isolated by disruption with a French press and sucrose gradient centrifugation. The receptor complexes were separated using a salt and acetonitrile gradient prior to digestion with trypsin. The peptides were analyzed by LC-ESI MS/MS using a linear ion trap (Thermo) with the SEQUEST algorithm. In addition ligand affinity chromatography was performed using IgG, oxLDL or anti CD36 microbeads incubated with crude extracts. Controls included uncoated, or ligand coated, beads incubated in crude extract and/or used experimental medium. Certain integrins were shown to be specifically associated with IgG versus oxLDL and/or control treatments. The functional requirement for these integrins was tested using silencing RNA and quantitative assays of phagocytosis using laser scanning confocal microscopy. For the first time we show a small but statistically significant role for integrins in IgG-Fcγ receptor mediated phagocytosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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