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Enregistrement W4229589024 · doi:10.1002/cytob.21116

Determination of optimal replicate number for validation of imprecision using fluorescence cell based assays: Proposed practical method

2013· article· en· W4229589024 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensLondon Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReplicateRepeatabilityEnumerationCoefficient of variationAnalyteFlow cytometryBiologyComputational biologyImmunologyChromatographyStatisticsMathematicsChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Assay validation includes determination of inherent imprecision across the reportable range. However specific practical guidelines for determinations of precision for cell based fluorescence assays performed on flow cytometers are currently lacking. Methods: Replicates of 10 or 20 measurements were obtained for flow cytometric assays developed for clinical IVD use, including neutrophil CD64 expression for infection/sepsis detection, fetal red cell enumeration for fetomaternal hemorrhage detection, human equilibrative nucleoside transporter 1 (hENT1) quantitation in leukocytes for possible correlation with drug responsiveness, and CD34+ hematopoietic stem cell (HSC) enumeration of apheresis products, using up to three different instrument platforms for each assay. For each assay, the mean, 95% confidence intervals of the mean (95%CI), standard deviation and coefficient of variation (CV) of sequential replicates were determined. Results: For all assays and most instrument platforms <5 replicates were found adequate to validate assay imprecision levels below the 5-10% CV for repeatability claimed by the manufacturers of these assays. Results plotted as a novel parameter derived from the 95%CI and the cumulative mean for replicates, termed variance factor (VF), provide a data driven means for determining optimal replicate numbers. Conclusions: The novel VF can provide information to guide the practical selection of optimal replicate numbers for validation of imprecision in flow cytometric assays. The optimal number of replicates was assay and instrument platform dependent. Our findings indicate 3-4 replicates are sufficient for most flow cytometric assays and instrument combinations, rather than the higher numbers suggested by CLSI guidelines for soluble analytes. © 2013 Clinical Cytometry Society.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil0,992

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle