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Enregistrement W4229608378 · doi:10.21236/ada443199

Locating a Prostate Cancer Susceptibility Gene on the X Chromosome by Linkage Disequilibrium Mapping Using Three Founder Populations in Quebec and Switzerland

2005· report· en· W4229608378 sur OpenAlexaboutno aff
William D. Foulkee

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typereport
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLinkage disequilibriumGeneticsLinkage (software)BiologyFounder effectProstate cancerChromosomeCancerGeneHaplotypeGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

At the Montreal site, 195 participants have consented to participate and their blood was drawn. We have another 15 men that have agreed to participate and their blood will be drawn in the next few months. We have recruited a total of 42 controls. The pedigrees for all controls and cases have been drawn. Ishihara charts were shown to all cases and controls and the results were recorded. At the Switzerland site, case ascertainment is underway. To date, an additional three urologist and a radio-oncologist have given their support to this project. 319 patients have been contacted and 102 have had a consultation with a DNA sampling. An additional 28 men have given their consent to participate at the Sion site. As well as continuing to look at the X chromosome for relevant markers, we have genotyped 11 microsatellite markers, spanning 34 megabases on chromosome 7, in approximately 140 of our cases. We observed suggestive differences between cases and controls for two markers located approximately 2.75 megabases apart at 7q11.23 (D7S2518 and D7S2204) . We also conducted the first phase of a SNP discovery project. We resequenced CHEK2 in 75 Ashkenazi Jewish individuals (25 prostate cancer, 25 breast cancer and 25 controls). We identified 5 novel SNPs. These are now under detailed investigation. Finally, we completed and published our study of the putative prostate cancer gene, MSR1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,098

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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