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Enregistrement W4229873741 · doi:10.3410/f.725785109.793549699

Faculty Opinions recommendation of Distinct but Concerted Roles of ATR, DNA-PK, and Chk1 in Countering Replication Stress during S Phase.

2018· dataset· en· W4229873741 sur OpenAlexaff
Frédéric Charron, Lukas Tamayo-Orrego

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2018
Typedataset
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueResilience and Mental Health
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthWellcome TrustMassachusetts General Hospital
Mots-clésReplication (statistics)DNA replicationComputational biologyDNAGeneticsDNA damageBiologyPsychologyVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ATR-Chk1 pathway is critical for DNA damage responses and cell cycle progression.Chk1 inhibition is more deleterious to cycling cells than ATR inhibition, raising questions about ATR and Chk1 functions in the absence of extrinsic replication stress.Here, we show that a key role of ATR in S phase is to coordinate RRM2 accumulation and origin firing.ATR inhibitor (ATRi) induces massive ssDNA accumulation and replication catastrophe in a fraction of early S-phase cells.In other S-phase cells, however, ATRi induces moderate ssDNA and triggers a DNA-PK and Chk1-mediated backup pathway to suppress origin firing.The backup pathway creates a threshold such that ATRi selectively kills cells under high replication stress, whereas Chk1 inhibitor induces cell death at a lower threshold.The levels of ATRi-induced ssDNA correlate with ATRi sensitivity in a panel of cell lines, suggesting that ATRi-induced ssDNA could be predictive of ATRi sensitivity in cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,185

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0050,007
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0550,043

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,436
Écart entre enseignants0,395 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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