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Enregistrement W4229937583 · doi:10.1002/9781118960608.gbm01273.pub2

<i> <scp>T</scp> hermotoga </i>

2019· other· en· W4229937583 sur OpenAlexaff
Camilla Nesbø, Anne A. Farrell, Olga Zhaxybayeva, Stéphane L’Haridon

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2019
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThermotoga maritimaBiologyGenus16S ribosomal RNAPhylogenetic treeThermophileBacteriaGeneZoologyGeneticsEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ther.mo.to'ga. Gr. fem. n. therme heat: L. fem. n. toga Roman outer garment: N.L. fem. n. Thermotoga the hot outer garment. The genus Thermotoga comprises sheathed, hyperthermophilic, anaerobic, fermentative, and hydrogen‐producing bacteria. These bacteria reduce thiosulfate and sulfur to sulfide. Thermotoga spp. are members of the phylum Thermotogota , class Thermotogae , order Thermotogales , family Thermotogaceae . Known habitats are geothermal heated marine sediments, shallow submarine thermal vents, hot springs, and oil reservoirs. Genome sizes of closed genomes are in the range 1.75–1.88 Mb, and GC content is 46.1–47.1%. Thermotoga spp. display high levels of homologous recombination and lateral gene transfer with both closely related and distantly related lineages. Phylogenetic analyses of 16S rRNA genes assign two recently described species, T. profunda and T. caldifontis, to the recently proposed genus Pseudothermotoga . Hence, we propose an emended description of the genus Thermotoga , which consists of four validly named species: T. maritima , T. neapolitana , T. naphthophila , and T. petrophila . DNA G + C content (mol%) : 46.1–47.1 (genome analysis). Type species : Thermotoga maritima Stetter and Huber 1986, 575 VP (Effective publication: Stetter and Huber in Huber, Langworthy, König, Thomm, Woese, Sleytr et al. 1986) Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Thermotoga is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Thermotogati / Thermotogota / Thermotogae / Thermotogales / Thermotogaceae / Thermotoga The genus Thermotoga can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Thermotoga (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Thermotogota / c__Thermotogae / o__Thermotogales / f__Thermotogaceae / g__Thermotoga * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , <jats

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,730
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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