<i> <scp>T</scp> hermotoga </i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Ther.mo.to'ga. Gr. fem. n. therme heat: L. fem. n. toga Roman outer garment: N.L. fem. n. Thermotoga the hot outer garment. The genus Thermotoga comprises sheathed, hyperthermophilic, anaerobic, fermentative, and hydrogen‐producing bacteria. These bacteria reduce thiosulfate and sulfur to sulfide. Thermotoga spp. are members of the phylum Thermotogota , class Thermotogae , order Thermotogales , family Thermotogaceae . Known habitats are geothermal heated marine sediments, shallow submarine thermal vents, hot springs, and oil reservoirs. Genome sizes of closed genomes are in the range 1.75–1.88 Mb, and GC content is 46.1–47.1%. Thermotoga spp. display high levels of homologous recombination and lateral gene transfer with both closely related and distantly related lineages. Phylogenetic analyses of 16S rRNA genes assign two recently described species, T. profunda and T. caldifontis, to the recently proposed genus Pseudothermotoga . Hence, we propose an emended description of the genus Thermotoga , which consists of four validly named species: T. maritima , T. neapolitana , T. naphthophila , and T. petrophila . DNA G + C content (mol%) : 46.1–47.1 (genome analysis). Type species : Thermotoga maritima Stetter and Huber 1986, 575 VP (Effective publication: Stetter and Huber in Huber, Langworthy, König, Thomm, Woese, Sleytr et al. 1986) Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Thermotoga is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Thermotogati / Thermotogota / Thermotogae / Thermotogales / Thermotogaceae / Thermotoga The genus Thermotoga can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Thermotoga (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Thermotogota / c__Thermotogae / o__Thermotogales / f__Thermotogaceae / g__Thermotoga * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 ,
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,432 | 0,208 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».