Associations of human leukocyte antigen DRB with resistance or susceptibility to HIV-1 infection in the Pumwani Sex Worker Cohort
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: A group of commercial sex workers in the Pumwani Sex Worker Cohort, established in 1985 in Nairobi, Kenya, remain HIV-1 uninfected despite heavy exposure to HIV-1 through active sex work. Previous studies showed that this resistance is associated with a strong CD4+ T-cell response, which suggested that human leukocyte antigen class II antigens are important in resistance/susceptibility to HIV-1 infection. DRB1 is the most polymorphic locus among class II genes and forms haplotypes with DRB3, DRB4 and DRB5. The aim of this study is to investigate the role of DRB alleles/haplotypes on resistance/susceptibility to HIV-1 infection. DESIGN: In total, 1090 women enrolled in the Pumwani cohort were genotyped for DRB1, DRB3, DRB4 and DRB5 using a high-resolution sequence-based method. Allele/haplotype frequencies were compared between HIV-positive women and women who have remained HIV negative for more than 3 years despite frequent exposure. METHODS: Human leukocyte antigen DRB genes were amplified, sequenced and genotyped using a two-step sequence-based method. Allele/haplotype frequencies were determined using PyPop32-0.6.0. Statistical analysis was conducted using SPSS 11.0 for Windows. RESULTS: Three DRB1 alleles were associated with resistance: DRB1*010101 (P = 0.016; odd ratio (OR): 2.55; 95% confidence interval (CI): 1.16-5.61), DRB1*010201 (P = 0.019; OR: 1.86; 95% CI: 1.10-3.15), and DRB1*1102 (P = 0.025; OR: 1.72; 95% CI: 1.07-2.78). DRB1*030201 (P = 0.038; OR: 0.48; 95% CI: 0.23-0.98), DRB1*070101 (P = 0.035; OR: 0.54; 95% CI: 0.30-0.97), DRB1*1503 (P = 0.0004; OR: 0.34; 95% CI: 0.19-0.64), and DRB5*010101 (P = 0.001; OR: 0.37; 95% CI: 0.20-0.67) were associated with susceptibility. The haplotype DRB1*1102-DRB3*020201 was associated with HIV-1 resistance (P = 0.041; OR: 1.68; 95% CI: 1.02-2.78), whereas the haplotypes DRB1*070101-DRB4*01010101 (P = 0.041; OR: 0.52; 95% CI: 0.28-0.98) and DRB1*1503-DRB5*01010101 (P = 0.0002; OR: 0.30; 95% CI: 0.15-0.58) were associated with susceptibility. These associations with resistance/susceptibility to HIV-1 were independent of previously reported alleles HLA-DRB1*01 and HLA-A*2301. CONCLUSION: Our findings indicate that human leukocyte antigen DRB-specific CD4+ T-cell responses are an important factor in resistance/susceptibility to HIV-1 infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».