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Enregistrement W4230461787 · doi:10.12688/f1000research.21299.1

Multidrug-resistant Campylobacter jejuni, Campylobacter coli and Campylobacter lari isolated from asymptomatic school-going children in Kibera slum, Kenya

2020· preprint· en· W4230461787 sur OpenAlexfundno aff
Nduhiu Gitahi, P B Gathura, Michael M. Gicheru, Beautice M. Wandia, Annika Nordin

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGrand Challenges CanadaVetenskapsrådet
Mots-clésCampylobacterBiologyGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<ns4:p> <ns4:bold>Background:</ns4:bold> The objective of this study was to determine the prevalence of thermophilic <ns4:italic>Campylobacter</ns4:italic> spp. in asymptomatic school-going children and establish the antibiotic resistant patterns of the isolates towards the drugs used to treat campylobacteriosis, including macrolides, quinolones and tetracycline. <ns4:italic>Campylobacter</ns4:italic> spp. are a leading cause of enteric illness and have only recently shown resistant to antibiotics. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Methods:</ns4:bold> This study isolated <ns4:italic>Campylobacter</ns4:italic> spp., including <ns4:italic>Campylobacter coli</ns4:italic> , <ns4:italic>Campylobacter jejuni</ns4:italic> and <ns4:italic>Campylobacter lari</ns4:italic> , in stool samples from asymptomatic school-going children in one of the biggest urban slums in Kenya. The disc diffusion method using EUCAST breakpoints was used to identify antibiotic-resistant isolates, which were further tested for genes encoding for tetracycline resistances using primer-specific polymerase chain reaction. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Results:</ns4:bold> In total, 580 stool samples were collected from 11 primary schools considering both gender and age. Subjecting 294 biochemically characterized <ns4:italic>Campylobacter</ns4:italic> spp. isolates to genus-specific PCR, 106 (18.27% of stool samples) isolates were confirmed <ns4:italic>Campylobacter</ns4:italic> spp. Out of the 106 isolates, 28 (4.83%) were <ns4:italic>Campylobacter</ns4:italic> <ns4:italic>coli</ns4:italic> , 44 (7.58%) were <ns4:italic>Campylobacter jejuni</ns4:italic> while 11 (1.89%) were <ns4:italic>Campylobacter</ns4:italic> <ns4:italic>lari</ns4:italic> . <ns4:italic>Campylobacter jejuni</ns4:italic> had the highest number of isolates that were multi-drug resistant, with 26 out of the 28 tested isolates being resistant to ciprofloxacin (5 mg), nalidixic acid (30 mg), tetracycline (30 mg) and erythromycin (15 mg). </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Conclusions:</ns4:bold> In conclusion, a one-health approach, which considers overlaps in environment, animals and human ecosystems, is recommended in addressing campylobacteriosis in humans, since animals are the main reservoirs and environmental contamination is evident. </ns4:p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,140
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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