Assessment by differential display‐RT‐PCR of mRNA transcript transitions and α‐amanitin sensitivity during bovine preattachment development
Notice bibliographique
Résumé
The objectives of this study were to compare patterns of mRNA expression, investigate the onset of transcription, and isolate stage-specific and α-amanitin-sensitive mRNAs during early bovine development by differential-display-reverse transcription-polymerase chain reaction (DD-RT-PCR). Embryos representing a preattachment developmental series from the 1-cell to the expanded/hatched blastocyst stage were cultured in synthetic oviduct fluid medium + citrate and amino acids (cSOFMaa) with and without α-amanitin (100 μg/mL) for 4 and 12 hr. mRNA profiles were displayed by DD-RT-PCR using 5′ primers A and N. Total conserved cDNA banding patterns varied according to embryo stage with cDNA band numbers declining during early cleavage stages compared to oocyte values and then increasing in total number from the 6–8-cell stage through to the blastocyst stage. A cDNA banding pattern was established at the 8–16-cell stage that was largely unchanged through to the blastocyst stage. These findings with respect to cDNA banding patterns were conserved between oligo primer sets and experimental replicates. α-Amanitin sensitivity was first detected at the 2–5-cell stage but became predominant following the 6–8-cell stage of development to eventually affect the appearance of up to 40% of all cDNA bands by the blastocyst stage. A 12 hr α-amanitin treatment was required to effectively block 3H-uridine incorporation into mRNA in blastocyst stage embryos. Several stage-specific and α-amanitin-sensitive cDNAs were isolated and they will be a focus for future studies. In conclusion, DD-RT-PCR is an effective tool for contrasting gene expression patterns and isolating uncharacterized mRNA transcripts during bovine early development. Mol. Reprod. Dev. 55:152–163, 2000. © 2000 Wiley-Liss, Inc.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».