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Enregistrement W4230656068 · doi:10.1149/ma2016-02/51/3842

Exosomes Detection by a Label-free Localized Surface Plasmonic Resonance Method

2016· article· en· W4230656068 sur OpenAlexaff
R. Duraichelvan, B. Srinivas, Simona Bǎdilescu, Rodney J. Ouellette, Anirban Ghosh, Muthukumaran Packirisamy

Notice bibliographique

RevueECS Meeting Abstracts · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensAtlantic Cancer Research InstituteConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiotinylationStreptavidinSurface plasmon resonanceExosomeNanotechnologyMaterials scienceSurface modificationNanoparticleSilver nanoparticleMicrovesiclesPlasmonChemistryBiophysicsBiotinBiochemistryOptoelectronics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Exosomes contain disease biomarkers for cancer and other pathological conditions. They are groups of nano-scale extracellular communication organelles which dynamically transport cargoes of molecules and genetic materials between cells. Exosomes circulating in our body-fluids provide a snap-shot in real-time for virtually all aspects of our physiology. Isolation detection and quantification methods of exosomes from various bio-fluids are challenging for clinical applications, like liquid biopsy. Here, we present a simple label-free technique to capture and detect exosomes integrating an exosome-capturing synthetic polypeptide (called Vn96) into microfluidic device. We use our in-house developed nanocomposite plasmonic sensing platform, prepared by in-situ synthesis of Ag-PDMS (silver- polydimethylsiloxane), using silver nitrate as the silver nanoparticle precursor by the in-situ reduction of silver ions. The Ag-PDMS nanocomposites are subsequently high-temperature annealed to improve the uniformity of morphology to accomplish improved sensing properties. We grafted the Vn96 peptide on the Ag-PDMS nanoparticle using functionalization chemistry to covalently attach streptavidin followed by affinity-grafting of biotinylated Vn96 peptide on streptavidin. The biotinylated Vn96 peptide has a polyethylene glycol linker between the peptide and biotin moieties providing flexibility to Vn96 to access and capture exosomes from contacting bio-fluids. We measured localized surface plasmon resonance (LSPR) bands of Ag for all the chip development steps mentioned above and after exosome-capture. The Ag plasmon band shifts to longer wavelengths (redshift) as the refractive index of the surrounding medium is increased at each step of the protocol till exosome-capture-step. The extent of the red shift of the Ag LSPR band is proportional to the concentration of exosome in the fluid till saturation of Vn96 on the Ag-PDMS nanocomposite. Hence, the concentration of exosomes in a bio-fluid can be measured by using calibration curves without pre- or post- labelling exosomes. This exosome-capture chip can efficiently quantitate exosomes present in a fluid and will be used for subsequent molecular analysis (protein and nucleic acid) to facilitate liquid biopsy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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Résumé présentoui

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