Notice bibliographique
Résumé
biogenesis factors, 205 90S preribosomal complex, 204 90S preribosome particles, 205 Absolute quantifi cation (AQUA), 148, 150 Acetylation, 17, 23 Achromobacter protease I, 89 Acid-cleavable linker, 136 Actinomycin D (inhibitor of RNA polymerase I), 170, 233, 234 Activity-based protein profi ling (ABP), 16 Affi nity purifi cation, 177 Affi nity purifi cation-tags, 176 Affi nity-tag-fused protein, 188 Affi nity-tag purifi cation, 174 All-in one capillary column, 73 All-in-one ESI column, 74 Aminoethylcycteine, 111, 114 Aminoethylcycteine modifi cation, 113 Anaphase-promoting complex, 197 Anion exchange (AE), 72 Antibody-fi xed beads, 180, 181 Antibody-fi xed protein G-Sepharose beads, 185 Anti-FLAG antibody-fi xed beads, 210 Arf, 208 ASAPRatio, 143 Assembly snapshot, 205 Assembly snapshot analysis, 171, 202 Automated multidimensional LC-MS/MS, 197 Automated quantifi cation, 144 Avidin, 106 INDEX C. elegans, 96, 98, 123 Capillary column, 74 13 C4-succinic anhydride, 140 α-Casein, 116 β-Casein, 116 Cataloging proteomics, 15 CD4/lck receptor, 197 Cell-surface proteins, 102 Cellular localization, 204 Cellular machinery, 196 Chaperonin (GroEL), 15 Cleavable stable isotope-labeled synthetic peptide, 149 cMyc, 208 Coding sequence (CDS) identifi er, 97 Codon adaptation index (CAI), 99, 100 Collision-induced dissociation (CID), 10, 11 Column packing, 76, 77 Complex-interaction proteomics, 16 Con-A agarose column, 121 Coomassie blue, 4 cprotein complex, 168 cullin-RING ubiquitin ligase complex, 197 Culture-derived isotope tag (CDIT), 134 α-Cyano-4-hydroxycinnamic acid, 7 Cytoplasm, 204 DAT fi le, 88 Database search, 88 Data-dependent collision-induced dissociation MS/MS, 84 Data-dependent tandem MS, 66 DDX47-associated pre-rRNP complexes, 218, 232 Descriptive proteomics, 15 Diagnosis, 13 Diamond-Blackfan anemia, 208 5,6-Dichlorobenzimidazole riboside (DRB, inhibitor of RNA polymerase II), 234 Different LC-MS, 146 Dimethyl pimelimidate (DMP), 181 Direct analysis of large protein complexes (DALPC), 68 Direct delivery pump, 79 Direct nano LC (DNLC) system, 80, 83 Double-tagging approach, 177, 179 Double-tagging methodology, 196 Dynamic analysis, 224 Dynamic range of protein abundance, 14 Dyskeratosis congentia, 208 Edman aequencing, 5 EGF-receptor-MAP kinase, 197 Electrical switching valve, 81 Electrospray ionization (ESI), 6, 7 Electrospray ionization apparatus, 72 Electrospray ionization interface, 73 Electrospray ionization-MS/MS, 12 Electrospray ionization spray needle, 72 Electrospray ionization-ToF MS, 65 β-Elimination, 18, 110, 113 emPAI, 91, 152 Endopeptidase Lys-C, 8 Enhancer binding protein α (EBPα), 197 Epitope-tag, 174 Epitope-tagged ubiquitin, 127 Escherichia coli, 98 Estrogen receptor, 196 Exosome, 218 Exponentially modifi ed version of PAI (emPAI), 152 Expression proteomics, 15 Extracted ion chromatograms (XICs), 140 Factor Xa recognition sequence, 188 Fast atom bombardment (FAB), 6 Fibrillarin, 208 Fibrillarin (FIB)-associated pre-rRNP complex, 223, 231 FLAG epitope, 196 FLAG-tag, 176, 179 Fluorescence loss in photobleaching (FLIP), 234 Fluorescence recovery after photobleaching (FRAT), 234 Fluorescent dye, 4 Focused proteomics, 16 Fourier transformed ion cyclotron resonance (FT-ICR), 6 Fraction-splitting phenomenon, 92 Fragment ion mass spectrum, 10 FT-ICR-MS, 70 Functional annotation, 236 Functional proteomics, 15, 101 Gas phase protein sequencer, 5 Gel-based technique, 10 Gel electrophoresis, 63 Gene ontology (GO) database, 108 Genome, 2 Global analysis of protein expression, 14 Global proteome machine, 71 Glucocorticoid receptor, 197 GluR6 kainate receptor, 197 Glutathione-S-transferase (GST)-tag, 176, 188 Glycosylation, 17, 21 Glysine-glysine (GG) modifi cation, 125 Gradient device, 80 10.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,784 | 0,738 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».