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Enregistrement W4231175943 · doi:10.1093/jmedent/47.4.565

Deep Mitochondrial DNA Lineage Divergences Within Alberta Populations of Dermacentor albipictus (Acari: Ixodidae) Do Not Indicate Distinct Species

2010· article· en· W4231175943 sur OpenAlexaboutno aff
Sarah S. T. Leo, M. J. Pybus, Felix A. H. Sperling

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Entomology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMitochondrial DNATickLineage (genetic)IxodidaeZoologyGenetic variationEvolutionary biologyGeneticsGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The winter tick Dermacentor albipictus (Packard) has a single-host life cycle that allows it to reach severe infestation levels on ungulates, particularly moose. Genotypic variation within these and related ticks has been a source of taxonomic confusion, although the continuity in their morphology and life history has generally been interpreted as indicating the existence of a single species. To further investigate this variation, we sequenced regions of two mitochondrial DNA (mtDNA) genes (COI and 16S rDNA), two nuclear genes (lysozyme and ITS-2), and two bacterial markers from Francisella-like endosymbionts found in these ticks (eubacterial mtDNA 16S rRNA and a homolog of Francisella tularensis [Dorofe’ev] 17-kDa lipoprotein). We sampled 42 D. albipictus individuals from whitetail and mule deer culled from three populations in east-central Alberta, as well as four D. albipictus and two Dermacentor variabilis (Say) from other locations. We then compared DNA sequence variation between the genes and related this to variation in the morphology of spiracle plates. Both mtDNA regions indicated two deeply diverged lineages (mean difference of 7.1% for COI and 4.5% for 16S) that would normally be considered diagnostic of distinct species in DNA barcoding studies. However, very little divergence was revealed by nuclear gene sequences, bacterial endosymbionts, and morphometric analyses, and any variation that did occur in these markers was not congruent with mtDNA divergences. We conclude that the sampled populations in Alberta represent a single species, D. albipictus, and reiterate the importance of integrative approaches in species delimitation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,186
Score d'incertitude au seuil0,990

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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