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Enregistrement W4231260040 · doi:10.21203/rs.3.rs-84403/v1

Best Practices for Human Milk Collection for COVID-19 Research

2020· preprint· en· W4231260040 sur OpenAlexaff
Shelley McGuire, Antti Seppo, Ameena Goga, Danilo Buonsenso, María Carmen Collado, Sharon M. Donovan, Janis A. Müller, Gastón Ofman, Michele Monroy-Valle, Deborah L. O’Connor, Ryan M. Pace, Philippe Van de Perre

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueInfant Nutrition and Health
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakData collectionComputer scienceVirologyBiologyMedicineMathematicsStatisticsInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In addition to providing life-giving nutrients and other substances to the breastfed infant, human milk can also represent a vehicle of pathogen transfer. As such, when an infectious disease outbreak, epidemic, or pandemic occurs – particularly when it is associated with a novel pathogen – the question will naturally arise as to whether the pathogen can be transmitted via breastfeeding. Until high-quality data are generated to answer this question, abandonment of breastfeeding due to uncertainty can result. The COVID-19 pandemic, which was in full swing at the time this document was written, is an excellent example of this scenario. During these times of uncertainty, it is critical for investigators conducting research to assess the possible transmission of pathogens via milk, whether by transfer through the mammary gland or contamination from respiratory droplets, skin, breast pumps, and milk containers, and/or close contact between mother and infant. To promote the most rigorous science, it is critical to outline optimal methods for milk collection, handling, storage, and analysis in these situations, and investigators should openly share their methods in published materials. Otherwise, the risks of inconsistent test results from pre-analytical and analytical variation, false positives, and false negatives are unacceptably high and the ability to provide public health guidance poor. Here we provide “best practices” for collecting human milk samples for COVID-19 research with the intention that this will also be a useful guide for future pandemics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,123
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,179
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,123
Score d'incertitude au seuil0,651

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1230,179
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0070,004
Études des sciences et des technologies0,0040,005
Communication savante0,0090,006
Science ouverte0,0070,007
Intégrité de la recherche0,0070,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0260,069

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,643
Tête enseignante GPT0,642
Écart entre enseignants0,001 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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