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Enregistrement W4231384111 · doi:10.1371/journal.pone.0207138

Evidence of transmission of Clostridium difficile in asymptomatic patients following admission screening in a tertiary care hospital

2019· article· en· W4231384111 sur OpenAlexaff
Prameet M. Sheth, Katya Douchant, Yvonne Uyanwune, Arravinth Anantharajah, Emily Borgundvaag, Lorraine Dales, Liz McCreight, Laura McNaught, Christine Moore, Kelsey Ragan, Allison McGeer, George Broukhanski

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensMount Sinai HospitalPublic Health OntarioToronto Public HealthKingston General HospitalQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarriageClostridium difficileAsymptomaticMedicineAsymptomatic carrierDiarrheaInternal medicineTransmission (telecommunications)FecesMicrobiologyTypingBiologyAntibioticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Clostridium difficile (CD) is the leading cause of infectious health-care associated diarrhea. However, little is known regarding CD carriage and transmission amongst asymptomatic colonizers. We evaluated carriage, characterized strains and examined epidemiologic linkages in asymptomatic colonized CD patients. METHODS: Rectal swabs from asymptomatic patients admitted to the general medicine ward from April 1-June 30 2012 were collected. PCR-confirmed CD colonies were ribotyped and characterized by Modified-Multi Locus Variable Number Tandem Repeat Analysis (MMLVA). RESULTS: 1549-swabs were collected from 474-patients. Overall, 50/474(10.6%) were CD PCR-positive, 24/50 were colonized at admission, while 26/50 were first identified > = 72 hours after admission. Amongst the 50 CD PCR-positive patients, 90% were asymptomatically colonized and 80% of individuals carried toxigenic CD-strains, including ribotype-027 (5/45:11%). MMLVA revealed five-clusters involving 15-patients harboring toxigenic (4/5) and non-toxigenic CD strains (1/5). In two clusters, patients were CD positive on admission while in the other three clusters involving 10 patients, we observed CD transmission from asymptomatically colonized patients to 8 previously CD-negative patients. CONCLUSIONS: We identified increasing rates of colonization during admission to medical wards. MMLVA typing effectively discriminated between strains and suggests that 20% of patients with CD colonization acquired their strain(s) from asymptomatically colonized individuals in hospital.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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