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Enregistrement W4231466118 · doi:10.1080/07060661.2017.1386715

Physiological specialization of <i>Puccinia triticina</i>, the causal agent of wheat leaf rust, in Canada in 2011

2017· article· en· W4231466118 sur OpenAlexaffvenueabout
Brent McCallum, P. Seto-Goh, Allen Xue

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesSolar Energy Technologies Office
Mots-clésRust (programming language)Wheat leaf rustBiologyBotanyComputer scienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leaf rust collections were made across Canada in 2011 and 287 single-pustule isolates were tested for virulence on 16 standard differential lines and two additional lines containing Lr21 and LrCen, respectively. Of the 70 different virulence phenotypes found in Canada during 2011, the most common were TDBJ (12.5%), TDBG (10.5%) and MLDS (7.7%), which is similar to the findings from 2010. Three isolates from Alberta each had a unique virulence phenotype. From Manitoba and Saskatchewan, 33 virulence phenotypes were found among 216 isolates, with the most common being TDBJ (16.7%), TDBG (13.9%), MLDS and TBBG (both at 9.3%). There were 29 virulence phenotypes among 47 isolates from Ontario, with MBTN (25.5%), MCTN (8.5%) predominating. Ten virulence phenotypes were found from 11 isolates in Quebec, and six virulence phenotypes among 10 isolates from Prince Edward Island. Compared with 2010, there were increases in the frequencies of virulent isolates in Canada to Lr2a, Lr2c, Lr16, Lr26, Lr3ka, Lr11 and Lr30 while there were declines in the frequencies of virulent isolates to Lr9, Lr24, Lr10 and Lr14a. When a group of 161 representative isolates were tested on five adult plant differentials, all isolates were avirulent to Lr22a, most were virulent to Lr12, Lr13 and Lr37, while only 16 were virulent to Lr35. When this same group of isolates was tested on 12 additional lines at the seedling stage, all isolates were avirulent to Lr19, Lr32, Lr29 and Lr52 and virulent to Lr15, while they differed in their reactions to Lr2b, Lr3bg, Lr14b, Lr20, Lr23, Lr25 and Lr28. Virulence for Lr21 was detected for the first time in Canada from five different virulence phenotypes, though at a low frequency (3.8%). This finding has implications for wheat breeding in Canada, since Lr21 had been completely effective since its release in the cultivar ‘AC Cora’ in 1994.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,121

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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