AMMI Canada – CACMID Annual Conference
Notice bibliographique
Résumé
Objectives: Campylobacter (C) is a common human enteropathogen.Published data on susceptibility rates from human Canadian Campylobacter isolates is scarce.We analyzed the characteristics of a 38 month cohort of Campylobacter strains isolated from stool specimens in a New Brunswick regional laboratory.We also present the susceptibility data of a subset of C jejuni isolates to ciprofloxacin (cip) and erythromycin (ery).MethOds: We retrieved data from stool cultures collected between August of 2011 and October of 2014 in which Campylobacter was isolated.We used Campylobacter CNA agar as the selective medium.Identification was performed using published methods.Isolates not identified as C jejuni sp jejuni or C coli were identified by sequencing of the cpn60 gene at a reference laboratory.Susceptibility of C jejuni to cip and ery was determined by Kirby-Bauer (KB) since May of 2013, using criteria described by Gaudreau.Travel history was obtained from New Brunswick public health.Results: Campylobacter was isolated in 2.1% of samples.82 separate episodes of enteritis were identified.Campylobacter was grown from all samples collected in 85% of enteritis cases.We isolated: C jejuni (72%), C lari (10%), C coli (7%), C upsaliensis (5%), 2% of other species and 4% of isolates not further identified.29 isolates of C jejuni were tested by KB.Resistance to nalidixic acid (na) was seen in 6/7 of cip resistant but in no cip susceptible strains.76% (22/29) of C jejuni isolates were susceptible to cip and 97% (28/29) to ery.Acquisition outside Canada was seen in 5/7 of isolates resistant to cip, but in only 1/22 of cip susceptible ones.Based on a Bayesian analysis with binomial distribution, Beta(1,1) prior and 10,000 simulations, there was a 99.99% probability that the percentage of resistant cases to cip was higher for contamination outside Canada.cOnclusiOns: C jejuni and C lari are the most common species isolated in our laboratory.Most cases of C jejuni resistant to cip in our area are acquired outside Canada.Macrolides such as azithromycin are the therapeutic agents of choice in New Brunswick, especially if the infection is acquired outside Canada.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,389 | 0,104 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».