Contraction of a Maternal Fragile X Mental Retardation 1 Premutation Allele
Notice bibliographique
Résumé
Fragile X syndrome (FXS) is mainly caused by an expansion of a cytosine-guanine-guanine (CGG) trinucleotide repeat (greater than 200) in the 5’ untranslated region of the fragile X mental retardation 1 ( FMR1 ) gene resulting in gene silencing, methylation, and absence of FMRP. FXS involves a wide spectrum of phenotypes including intellectual disabilities, autism spectrum disorder (ASD), maladaptive behaviors or symptoms, social anxiety, mood disorders and physical features. Carriers of premutation alleles (55 - 200 CGG repeats) can manifest with neurodevelopmental phenotypes and are at risk for the neurodegenerative fragile X-associated tremor/ataxia syndrome (FXTAS) and about 20% of women with a premutation develop fragile X-associated primary ovarian insufficiency (FXPOI). These phenotypes are believed to be caused by a distinct molecular mechanism involving increased FMR1 mRNA production and toxicity. Premutation alleles are unstable and depending on the CGG length and the presence of AGG interruptions have the potential to expand to larger premutation or full mutation alleles during transmission from mothers to their children. The contraction of a CGG repeat allele, although rare, has been observed. Here, we report the case of a three-generation family, who was identified as part of a pilot study of newborn screening for FXS. Specifically, the maternal grandmother carried a premutation allele (109 CGG repeats), which contracted to an intermediate size allele (52 CGG repeats) in her son, the father of a newborn girl (proband). This allele expanded to a premutation allele of 59 CGG repeats in the proband newborn. A premutation allele of 61 CGG repeats was detected in the proband’s sister who demonstrated social phobia but normal cognition. The proband newborn showed some fragile X associated physical stigmata but normal cognition. Intriguingly, all FMR1 CGG expanded allele showed no AGG interruptions. This case shows a remarkable instability of premutation alleles throughout the three generations likely arising from different mechanisms. J Med Cases. 2015;6(12):547-553 doi: https://doi.org/10.14740/jmc2301w
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».