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Enregistrement W4232508855 · doi:10.3410/f.3842957.3593057

Faculty Opinions recommendation of Reversible microbial colonization of germ-free mice reveals the dynamics of IgA immune responses.

2010· dataset· en· W4232508855 sur OpenAlexfundno aff
Lora V. Hooper

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2010
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOncosuisseSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungCanada Research ChairsCanadian Association of GastroenterologyCrohn's and Colitis FoundationCrohn's and Colitis Foundation of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaNational Science Foundation
Mots-clésImmune systemColonizationBiologyAntibodyImmunologySecretory IgAMicrobiologyCommensalismImmunoglobulin AImmunitySpecific-pathogen-freeBacteriaImmunoglobulin GGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The lower intestine of adult mammals is densely colonized with non-pathogenic (commensal) microbes.Gut bacteria induce protective immune responses, which ensure host-microbial mutualism.The continuous presence of commensal intestinal bacteria has made it difficult to study mucosal immune dynamics.Here we report a reversible germ-free colonization system in mice that is independent of diet or antibiotic manipulation.A slow (>14 days) onset of a longlived (t1/2>16 weeks), highly specific anti-commensal IgA response in germ-free mice was observed.Ongoing commensal exposure in colonized mice rapidly abrogated this response.Sequential doses lacked a classical prime-boost effect seen in systemic vaccination, but specific IgA induction occurred as a stepwise response to current bacterial exposure, such that the antibody repertoire matched the existing commensal content.Immunoglobulin (Ig)A is the dominant antibody produced in mammals, mostly secreted across mucous membranes, especially in the intestine.Intestinal dendritic cells (DCs) sample small numbers of commensal bacteria at the mucosal surface and induce IgAproducing B cells through T cell-dependent and independent mechanisms (3-5).It has long been known that the IgA responses in the intestine are strongly induced by colonization of germ-free animals with commensal bacteria.The kinetics and longevity of these responses are unknown, however, because it has not been possible to uncouple IgA induction from constant bacterial exposure.We developed a reversible in vivo germ-free colonization system by studying the persistence of auxotrophic E. coli K-12 mutants with a requirement for essential nutrients that could not be satisfied by any mammalian host metabolites (fig.S1A).Initial experiments in which germ-free mice were gavaged with an asd deletion mutant deficient in meso-diaminopimelic acid (m-DAP) biosynthesis (6) resulted in persistent intestinal

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,168

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0500,037

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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