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Enregistrement W4232579549 · doi:10.1021/jp205777a

Volumetric Characterization of Interactions of Glycine Betaine with Protein Groups

2011· article· en· W4232579549 sur OpenAlexafffund
Yuen Lai Shek, Tigran V. Chalikian

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineChemical Engineering
ThématiqueThermodynamic properties of mixtures
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChemistryBetaineMoleculeGlycineAmino acidThermodynamicsSolventCrystallographyPhysical chemistryOrganic chemistryPhysicsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the partial molar volumes and adiabatic compressibilities of N -acetyl amino acid amides and oligoglycines at glycine betaine (GB) concentrations ranging from 0 to 4 M. We use these results to evaluate the volumetric contributions of amino acid side chains and the glycyl unit (−CH 2 CONH−) as a function of GB concentration. We analyze the resulting GB dependences within the framework of a statistical thermodynamic model and evaluate the equilibrium constant for the reaction in which a GB molecule binds each of the functionalities under study replacing four water molecules. We calculate the free energy of the transfer of functional groups from water to concentrated GB solutions, Δ G tr, as the sum of a change in the free energy of cavity formation, ΔΔ G C, and the differential free energy of solute–solvent interactions, ΔΔ G I, in a concentrated GB solution and water. Our results suggest that the transfer free energy, Δ G tr, results from a fine balance between the large ΔΔ G C and ΔΔ G I contributions. The range of the magnitudes and the shape of the GB dependence of Δ G tr depend on the identity of a specific solute group. The interplay between ΔΔ G C and ΔΔ G I results in pronounced maxima in the GB dependences of Δ G tr for the Val, Leu, Ile, Trp, Tyr, and Gln side chains as well as the glycyl unit. This observation is in qualitative agreement with the experimental maxima in the T M -versus-GB concentration plots reported for ribonuclease A and lysozyme.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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