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Enregistrement W4232735940 · doi:10.1080/00275514.2001.12063240

<i>Pyrenophora</i>phylogenetics inferred from ITS and glyceradehyde-3-phosphate dehydrogenase gene sequences

2001· article· en· W4232735940 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMycologia · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyDrechsleraInternal transcribed spacerPhylogenetic treePhylogeneticsBotanyPyrenophoraCladeMonophylyRestriction fragment length polymorphismGeneticsGenePolymerase chain reaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phylogeny of Pyrenophora was analyzed based on DNA sequences of two regions: the internal transcribed spacers (ITS) and a fragment (ca 600 bp) of the gpd gene coding for glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. Thirty-nine isolates of Pyrenophora/Drechslera, together with 32 isolates of five genera as outgroups were analyzed in this study. Phylogenetic analysis of the ITS and the gpd data shows that Pyrenophora is monophyletic and supports the separation of Drechslera at generic rank from other graminicolous fungi. Within the Pyrenophora clade, the sequences from multiple isolates of the same species grouped together, and asexual states clustered with their predicted sexual relatives. Overall, the relationships of most Pyrenophora/Drechslera species inferred in this study were consistent with the relationships proposed from prior morphological studies. The ITS and the gpd data sets generated in this study provided a useful database that can be used to facilitate the identification of Pyrenophora/Drechslera isolates. Eight of the 21 isolates from CBS, and three of the 17 from DOAM, labeled as Pyrenophora/Drechslera from culture collections, appeared to be misidentified. With a combination of DNA sequences and morphological data, four of these isolates were re-identified as Bipolaris species. Five isolates were re-identified within the genus Pyrenophora. One of the remaining two misidentified isolates was a Corynespora and the other remains an unidentified ascomycete. The previous transfer of Drechslera heveae and D. portulacae to Cochliobolus was supported by these molecular data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,141
Score d'incertitude au seuil0,910

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle