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Enregistrement W4233151585 · doi:10.26434/chemrxiv.8299544

A De Novo Molecular Generation Method Using Latent Vector Based Generative Adversarial Network

2019· preprint· en· W4233151585 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensAstraZeneca (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutoencoderChemical spaceGenerative grammarArtificial intelligenceGenerative adversarial networkDeep learningSet (abstract data type)Artificial neural networkAdversarial systemComputer scienceMachine learningFraction (chemistry)Generative modelDrug discoveryPattern recognition (psychology)ChemistryBiochemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<p> </p><p>Deep learning methods applied to drug discovery have been used to generate novel structures. In this study, we propose a new deep learning architecture, LatentGAN, which combines an autoencoder and a generative adversarial neural network for de novo molecular design. We applied the method in two scenarios: one to generate random drug-like compounds and another to generate target-biased compounds. Our results show that the method works well in both cases: sampled compounds from the trained model can largely occupy the same chemical space as the training set and also generate a substantial fraction of novel compounds. Moreover, the drug-likeness score of compounds sampled from LatentGAN is also similar to that of the training set. Lastly, generated compounds differ from those obtained with a Recurrent Neural Network-based generative model approach, indicating that both methods can be used complementarily.</p><p> </p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle