Peer Review #1 of "Mediterranean swordfish (Xiphias gladius Linnaeus, 1758) population structure revealed by microsatellite DNA: genetic diversity masked by population mixing in shared areas (v0.1)"
Notice bibliographique
Résumé
Background.The Mediterranean swordfish stock is overfished and considered not correctly managed.Elucidating the patterns of the Mediterranean swordfish population structure constitutes an essential prerequisite for effective management of this fishery resource.To date, few studies have investigated intra-Mediterranean swordfish population structure, and their conclusions are controversial. Methods.A panel of 20 microsatellites DNA was used to investigate fine-scale population structuring of swordfish from six main fishing areas of the Mediterranean Sea.Results.This study provides evidence to reject the hypothesis of a single swordfish population within the Mediterranean Sea.DAPC analysis revealed the presence of three genetic clusters and a high level of admixture within the Mediterranean Sea.Genetic structure was supported by significant F ST values while mixing was endorsed by the heterozygosity deficit observed in sampling localities indicative of a possible Wahlund effect, by sampling admixture individuals .Overall, our tests reject the hypothesis of a single swordfish population within the Mediterranean Sea.Homing towards the Mediterranean breeding areas may have generated a weak degree of genetic differentiation between populations even at the intrabasin scale.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,013 | 0,076 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,002 |
| Communication savante | 0,007 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,272 | 0,150 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».