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Enregistrement W4233323025 · doi:10.7287/peerj.9518v0.1/reviews/1

Peer Review #1 of "Mediterranean swordfish (Xiphias gladius Linnaeus, 1758) population structure revealed by microsatellite DNA: genetic diversity masked by population mixing in shared areas (v0.1)"

2020· peer-review· en· W4233323025 sur OpenAlexaff
Tommaso Righi, Andera Splendiani, Tatiana Fioravanti, Andrea Petetta, Michela Candelma, Giorgia Gioacchini, Kyle Gillespie, Alex Hanke, Oliana Carnevali, Vincenzo Caputo, Barucchi Corresp, Vincenzo Caputo Barucchi, Andrea Splendiani

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSwordfishMicrosatelliteGeographyPopulationGenetic diversityMediterranean climateDiversity (politics)ZoologyBiologyFisheryGeneticsDemographyArchaeologyGeneAnthropologySociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background.The Mediterranean swordfish stock is overfished and considered not correctly managed.Elucidating the patterns of the Mediterranean swordfish population structure constitutes an essential prerequisite for effective management of this fishery resource.To date, few studies have investigated intra-Mediterranean swordfish population structure, and their conclusions are controversial. Methods.A panel of 20 microsatellites DNA was used to investigate fine-scale population structuring of swordfish from six main fishing areas of the Mediterranean Sea.Results.This study provides evidence to reject the hypothesis of a single swordfish population within the Mediterranean Sea.DAPC analysis revealed the presence of three genetic clusters and a high level of admixture within the Mediterranean Sea.Genetic structure was supported by significant F ST values while mixing was endorsed by the heterozygosity deficit observed in sampling localities indicative of a possible Wahlund effect, by sampling admixture individuals .Overall, our tests reject the hypothesis of a single swordfish population within the Mediterranean Sea.Homing towards the Mediterranean breeding areas may have generated a weak degree of genetic differentiation between populations even at the intrabasin scale.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,076
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,987
Score d'incertitude au seuil0,910

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,076
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0070,002
Études des sciences et des technologies0,0040,002
Communication savante0,0070,004
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2720,150

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineÉvaluation
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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