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Correction: Systematic Analysis of Immune Infiltrates in High-Grade Serous Ovarian Cancer Reveals CD20, FoxP3 and TIA-1 as Positive Prognostic Factors

2013· article· en· W4233381376 sur OpenAlexaff
Katy Milne, Martin Köbel, Steven E. Kalloger, Rebecca Barnes, Dongxia Gao, C. Blake Gilks, Peter H. Watson, Brad H. Nelson

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of VictoriaUniversity of British ColumbiaVancouver General HospitalBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCD20Serous fluidFOXP3Immune systemMHC class ICD8Tissue microarrayPathologyMedicineMHC class IICancer researchImmunologyBiologyImmunohistochemistryT cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Tumor-infiltrating T cells are associated with survival in epithelial ovarian cancer (EOC), but their functional status is poorly understood, especially relative to the different risk categories and histological subtypes of EOC.Methodology/Principal Findings: Tissue microarrays containing high-grade serous, endometrioid, mucinous and clear cell tumors were analyzed immunohistochemically for the presence of lymphocytes, dendritic cells, neutrophils, macrophages, MHC class I and II, and various markers of activation and inflammation.In high-grade serous tumors from optimally debulked patients, positive associations were seen between intraepithelial cells expressing CD3, CD4, CD8, CD45RO, CD25, TIA-1, Granzyme B, FoxP3, CD20, and CD68, as well as expression of MHC class I and II by tumor cells.Disease-specific survival was positively associated with the markers CD8, CD3, FoxP3, TIA-1, CD20, MHC class I and class II.In other histological subtypes, immune infiltrates were less prevalent, and the only markers associated with survival were MHC class II (positive association in endometrioid cases) and myeloperoxidase (negative association in clear cell cases).Conclusions/Significance: Host immune responses to EOC vary widely according to histological subtype and the extent of residual disease.TIA-1, FoxP3 and CD20 emerge as new positive prognostic factors in high-grade serous EOC from optimally debulked patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,129
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,221

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,129
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0660,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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