Primary Ciliary Dyskinesia in First Peoples of Canada
Notice bibliographique
Résumé
Chronic respiratory illnesses are common in indigenous populations and are associated with long-term sequelae, including increased bronchiectasis prevalence. While these sequelae are often attributed to antecedent respiratory infections, genetically inherited lung diseases, including primary ciliary dyskinesia (PCD), are seldom considered in indigenous patients. We present three geographically dispersed and unrelated cases of PCD in Canadian First Peoples. [Figure He was diagnosed with complex congenital heart disease (ventricular septal defect, double outlet right ventricle, pulmonary atresia, mitral hypoplasia, but no thoracic/visceral organ laterality defects), and developed chronic cough and nasal congestion shortly after birth. He has chronic ear effusions, recurrent respiratory infections, and persistent atelectasis in the right middle and left lower lobes. Genetic testing revealed homozygous, loss-of-function deletions of exon 5 in DNAL1.Case 2 is an 8-year-old girl with unrelated Mohawk parents from Kahnawake, Quebec, born at 32 weeks gestation, with situs inversus totalis and an atrial septal defect. She had right upper lobe atelectasis and chronic wet cough, and required critical care. Transmission electron microscopic analysis of ciliary axoneme revealed absent outer dynein arms and genetic testing showed homozygous, pathogenic variants in DNAH5 (c.6249G>A). The proband's younger sister and second cousin also have situs inversus totalis, compatible PCD phenotypes, and identical DNAH5 variants. Case 3 is a 56-year-old Inuit woman from Ungava Bay in Nunavik, Quebec with recurrent pneumonias, chronic wet cough and nasal congestion since infancy, and bronchiectasis in the lingula/lower lobes plus right middle lobar collapse. She has situs inversus totalis, conductive hearing loss, pan-sinusitis with polyposis, and several children without fertility assistance. Electron microscopic analysis was normal, but nasal nitric oxide was low (23 nL/min). Genetic testing revealed homozygous, pathogenic, novel variants (c.4095+2C>A), affecting the donor splice site at intron 22 in DNAH11. Discussion: These cases highlight the genetic heterogeneity of PCD within the various First Peoples of Canada, despite some of these sharing common lineages. The different homozygous variants found here illustrate the increased prevalence of autosomal recessive diseases in culturally isolated populations, with increased consanguinity rates, though perhaps unbeknownst to community members. Exploration of these possible founder variants in indigenous communities, including analysis in patients with chronic respiratory disease, bronchiectasis, and/or organ laterality defects, should discover more PCD in these geographically, culturally, and economically isolated peoples.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,007 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».