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Enregistrement W4233652758 · doi:10.4039/n05-033

Phylogenetic framework for <i>Dioryctria</i> (Lepidoptera: Pyralidae: Phycitinae) based on combined analysis of mitochondrial DNA and morphology

2005· article· en· W4233652758 sur OpenAlexaff
Yanli Du, Amanda D. Roe, Felix A. H. Sperling

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Entomologist · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyZoologyMitochondrial DNASpecies complexPhylogenetic treeGenusDNA barcodingMaximum parsimonyPyralidaeLepidoptera genitaliaCladeEvolutionary biologyBotanyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Coneworms of the genus Dioryctria Zeller are important lepidopterous pests of conifer cones throughout the Holarctic region. Seventy-nine Dioryctria species are currently recognized and arranged into 11 species groups, but a globally unified classification of these species groups has not been attained. We surveyed 14 Dioryctria species belonging to 7 species groups recognized as being taxonomically problematic. Mitochondrial DNA sequences and morphological characters were used to resolve relationships among and within species groups and species. Sequences were obtained for 2.3 kb of the mitochondrial COI + COII genes and related to 52 morphological characters. Parsimony analyses of separate and combined data showed that ( i ) the five included Chinese species ( D. abietella (Denis and Schiffermüller), D. rubella Hampson, D. nr. rubella , D. magnifica Munroe, and D. yiai Mutuura and Munroe) were distinct from the North American taxa, and their relationships were interspersed among Nearctic and European species; ( ii ) three of the four species groups represented by more than one species formed robust, well-supported clades ( abietella group, sylvestrella group, and zimmermani group) for both mtDNA sequences and morphology; ( iii ) mtDNA and morphology gave conflicting interspecific and intergroup relationships for the auranticella , schuetzeella , ponderosae , and baumhoferi groups; ( iv ) all eight species for which more than one specimen was sampled were characterized by discrete clusters of mitochondrial DNA haplotypes, and mtDNA divergences among species in the same species group were generally less than those among species in different species groups; and ( v ) combining mtDNA data with morphological data increased support for most nodes in the phylogeny, with morphological characters providing support for species groups and mtDNA being essential for distinguishing species within species groups. This study demonstrates the value of a combined analysis of both mtDNA and morphological characters and establishes a phylogenetic framework for broader and more comprehensive studies of Dioryctria species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,611
Score d'incertitude au seuil0,972

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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