MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4233709329 · doi:10.33774/chemrxiv-2021-w487v

Study of Pseudomonas aeruginosa PPF-1 biofilm formation using microfluidics: effect of magnesium on biofilm detachment in engineered conduits

2021· preprint· en· W4233709329 sur OpenAlexafffund
William Y. Harvey, Cynthia Gagné-Thivierge, Sepideh Fakari, Jean Barbeau, Steve J. Charette, Jesse Greener

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université Laval
Mots-clésBiofilmSloughingPseudomonas aeruginosaShear stressMicrofluidicsStrain (injury)MicrobiologyShear (geology)ChemistryMaterials scienceChemical engineeringNanotechnologyBacteriaComposite materialBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The bacterium Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen in certain organisms, including humans, but can also survive and proliferate in natural and engineered water systems. Microfluidic technology can address hydrodynamic questions related to bacterial contamination of water flow systems and infrastructure. In this work, a microfluidic approach was devised to study the effect of shear stresses on biofilms from a dental unit waterline (DUWL)-isolated P. aeruginosa strain, PPF-1. During application of relevant shear stress levels to DUWLs, the response of the PPF-1 biofilm was observed and compared to a clinical P. aeruginosa reference strain, PAO1. The response measurements were repeated for biofilms exposed to additional Mg2+ ions. Using a microfluidic approach to transforming optical density maps into three-dimensional images, we applied computational fluid dynamics simulations and determined the critical shear stresses for biofilm sloughing. In the absence of Mg2+, PPF-1 biofilms showed weaker attachment than PAO1 biofilms, resulting in continuous slough/regrowth cycles triggered by applied shear stresses of 1.42 +/- 0.32 Pa. Introducing Mg2+ into the PPF-1 biofilm culture medium seemed to place the biofilm into a viscoplastic mechanical state, thereby increasing mechanical stability, which resulted in elevated tolerances to shear stresses up to a critical value of 5.43 +/- 1.52 Pa. This resulted in a propensity for less frequent but more catastrophic sloughing events like that observed for the PAO1 reference strain. This suggests that in a low ionic environment, biofilms from the PPF-1 strain can result in higher and more continuous ejection of biofilm materials, possibly leading to increased downstream colonization of engineered flow systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetBacterial biofilms and quorum sensing→Travaux en français237 207→