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Enregistrement W4233710036 · doi:10.3410/f.735763839.793562364

Faculty Opinions recommendation of Mitochondrial fragmentation drives selective removal of deleterious mtDNA in the germline.

2019· dataset· en· W4233710036 sur OpenAlexfundno aff
Hyung Don Ryoo

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2019
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthCanada First Research Excellence FundHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésMitochondrial DNAFragmentation (computing)GermlineDNA fragmentationBiologyGeneticsGeneEcologyApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondria contain their own genomes, and unlike nuclear genomes, mitochondrial genomes are inherited maternally.With a high mutation rate and little recombination, special selection mechanisms exist in the female germline to prevent the accumulation of deleterious mutations [1][2][3][4][5] .The molecular mechanisms underpinning selection remain poorly understood 6 .Here, using an allele-specific fluorescent in situ-hybridization approach to distinguish wildtype from mutant mtDNA, we have visualized germline selection for the first time.Selection first manifests in the early stages of Drosophila oogenesis, triggered by reduction of the pro-fusion protein Mitofusin.This leads to the physical separation of mitochondrial genomes into different mitochondrial fragments, preventing the mixing of genomes and their products, and thereby reducing complementation.Once fragmentated, mitochondria harboring mutant genomes are less able to make ATP, which marks them for selection through a process requiring the mitophagy proteins Atg1 and BNIP3.Surprisingly, a reduction in Atg1 or BNIP3 decreases the amount of wildtype mtDNA, suggesting a link between mitochondrial turnover and mtDNA replication.Remarkably, fragmentation is not only necessary for selection in germline tissues, but also sufficient to induce selection in somatic tissues where selection is normally absent.Our studies posit a generalizable mechanism to select against deleterious mtDNA mutations that may allow the development of strategies for treatment of mtDNA disorders.To visualize germline selection, we designed fluorescently labeled DNA probes that bind specifically to unique regions of the D-loops of mtDNA from either D. melanogaster or a Users may view, print, copy, and download text and data-mine the content in such documents, for the purposes of academic research, subject always to the full Conditions of use:http://www.nature.com/

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,182

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0540,041

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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