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Enregistrement W4233931786 · doi:10.1016/s0378-1097(02)00508-6

LC-MS analysis of pig intestine sulfatides: Interaction with Escherichia coli STb enterotoxin and characterization of molecular species present

2002· article· en· W4233931786 sur OpenAlexaff
Hans-Erick Beausoleil

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueVeterinary medicine and infectious diseases
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEnterotoxinChemistryEscherichia coliMonoclonal antibodyEnterotoxigenic Escherichia coliBiochemistryFatty acidElectrospray ionizationResidue (chemistry)EpitopeChromatographyMass spectrometryAntibodyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

STb, a 48-amino acid thermostable enterotoxin is produced by enterotoxigenic Escherichia coli strains and is responsible for diarrheal diseases in many animals, including man. Our laboratory recently identified a family of molecules, from a lipid extract of porcine intestinal epithelial cells, that could bind to STb. These molecules were identified as sulfatides as they reacted with a monoclonal antibody raised against this family of molecules. However, as the epitope recognized by this monoclonal antibody was the galactose 3-sulfate, a doubt could remain as to the exact nature of the identified receptors. The goal of this study was thus to confirm the chemical nature of the STb-binding molecule as sulfatides or as distinctive molecules comprising a sulfated galactosyl residue. Using a thin-layer chromatography-overlay method we confirmed using antibodies to STb that STb recognizes the commercial sulfatides and a band migrating at the same level from the intestinal tissue lipid extract obtained from an 8-week-old piglet. The compounds recovered from the silica gel plates were analyzed by mass spectrometry in electrospray negative-ionization mode. The most abundant ions observed had m/z values of 779, 795, 879 and 907. For commercial bovine brain sulfatides the ions 795, 879 and 907 have been attributed to hydroxylated sulfatides with a saturated fatty acid chain containing 16, 22 and 24 carbons, while the 779 ion contained a saturated fatty acid chain of 16 carbons. The general profile of the ions observed was similar to the already described commercial bovine brain sulfatides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,548
Score d'incertitude au seuil0,652

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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