Peer Review #2 of "Lithocholic acid induces endoplasmic reticulum stress, autophagy and mitochondrial dysfunction in human prostate cancer cells (v0.1)"
Notice bibliographique
Résumé
Lithocholic acid (LCA) is a secondary bile acid that is selectively toxic to human neuroblastoma, breast and prostate cancer cells, whilst sparing normal cells.We previously reported that LCA inhibited cell viability and proliferation and induced apoptosis and necrosis of androgen-dependent LNCaP and androgen-independent PC-3 human prostate cancer cells.In the present study, we investigated the roles of endoplasmic reticulum (ER) stress, autophagy and mitochondrial dysfunction in the toxicity of LCA in PC-3 and autophagy deficient, androgen-independent DU-145 cells.LCA induced ER stressrelated proteins, such as CCAAT-enhancer-binding protein homologous protein (CHOP), and the phosphorylation of eukaryotic initiation factor 2-alpha (p-eIF2α) and c-Jun N-terminal kinases (p-JNK) in both cancer cell-types.The p53 upregulated modulator of apoptosis (PUMA) and B cell lymphoma-like protein 11 (BIM) levels were decreased at overtly toxic LCA concentrations, although PUMA levels increased at lower LCA concentrations in both cell lines.LCA induced autophagy-related conversion of microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B (LC3BI to LC3BII), and autophagy-related protein ATG5 in PC-3 cells, but not in autophagy-deficient DU-145 cells.LCA (>10 μM) increased levels of reactive oxygen species (ROS) concentration-dependently in PC-3 cells, whereas ROS levels were not affected in DU-145 cells.Salubrinal, an inhibitor of eIF2α dephosphorylation and ER stress, reduced LCA-induced CHOP levels slightly in PC-3, but not DU-145 cells.Salubrinal pre-treatment increased the cytotoxicity of LCA in PC-3 and DU-145 cells and resulted in a statistically significant loss of cell viability at normally non-toxic concentrations of LCA.The late-stage autophagy inhibitor bafilomycin A1 exacerbated LCA toxicity at subtoxic LCA concentrations in PC-3 cells.The antioxidant α-tocotrienol strongly inhibited the toxicity of PeerJ reviewing
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,037 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,009 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,403 | 0,203 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».